R语言 methVisual包 cgInAlign()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

cgInAlign(methVisual)
cgInAlign()所属R语言包：methVisual

                                        Amount of CpGs
                                         对的CPGs金额

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculating amount of CpGs between alignments border
路线边界之间的CPGs金额计算


用法----------Usage----------


cgInAlign(methData)



参数----------Arguments----------

参数：methData
An object of type list that contains information on the pairwise alignments and methylation status of all CpG motifs under study. Created by applying MethAlignNW()
一个对象类型的列表，其中包含成对的路线和所研究的所有CpG基序的甲基化状态的信息。创建应用MethAlignNW（）


Details

详情----------Details----------

This function computes the amount of CpGs on the positions corresponds to genomic sequence over all sequences under study between the alignment borders.
此函数计算金额的CPGs上的立场之间的对齐边界的所有正在研究的基因组序列的序列。


值----------Value----------

Integer vector of CpG amount
CpG的数量的整数向量


作者（S）----------Author(s)----------


Arie Zackay <arie.zackay@mail.huji.ac.il>, Christine Steinhoff <steinhof@molgen.mpg.de>



举例----------Examples----------


data(methData)
cgInAlign(methData)

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