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R语言 MEDME包 MEDME.writeFiles()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 00:39:30 | 显示全部楼层 |阅读模式
MEDME.writeFiles(MEDME)
MEDME.writeFiles()所属R语言包:MEDME

                                         writeFiles sgr or gff files from MEDME output
                                         SGR writeFiles GFF或从MEDME的输出文件

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

allows to write sgr or gff files after MEDME analysis
允许编写后MEDME分析的SGR或GFF文件


用法----------Usage----------


MEDME.writeFiles(data, output, path = getwd(), format, featureLength  = NULL)



参数----------Arguments----------

参数:data
An object of class MEDMEset
一个类MEDMEset对象


参数:output
string; the name of the data slot to be written on the disk, either logR, smoothed, AMS or RMS
字符串;数据槽的名字写在磁盘上,无论是logR,平滑,医疗辅助队或RMS


参数:path
string; the path where the files are stored; the current working directory is the default  
字符串;文件存储的路径,当前工作目录是默认


参数:format
string; either sgr or gff to indicate the respective file formats  
字符串; SGR或GFF表明各自的文件格式


参数:featureLength
integer; in case of GFF file format the length of the features has to be provided to determine start and end positions  
整数; GFF文件格式的情况下,长度必须提供的功能,以确定起始和结束位置


Details

详情----------Details----------

One GFF or SGR file is provided for each sample of the data MEDMEset object.
为每个样品的数据MEDMEset对象提供一个GFF或SGR的文件。

In case of GFF files, tab-delimited files with header are provided with following fields for each probe: chromosome, empty field, probe ids, start and stop chromosomal positions, and score and empty fields.
在GFF档案的情况下,头制表符分隔的文件提供以下领域为每个探针:染色体,空场,IDS探针,启动和停止染色体的位置,得分和空领域。

In case of sgr files, tab-delimited files with no header and chr, chr positions and score are provided.
在SGR文件的情况下,没有头和chr,字符位置和得分的制表符分隔的文件。

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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