R语言 mBPCR包 estGlobParam()函数中文帮助文档(中英文对照)

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estGlobParam(mBPCR)
estGlobParam()所属R语言包：mBPCR

                                        Estimate global parameters of copy number data
                                         估计全球拷贝数数据参数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to estimate the global parameters of copy number data: the mean and the variance of the segment levels (called nu and rhoSquare, respectively), the variance of the noise (sigmaSquare). It is possible to choose the estimator of rhoSquare (i.e. either \hat{ρ}_1^2 or \hat{ρ}^2) and by default \hat{ρ}_1^2 is used.
函数估计拷贝数数据的全局参数：均值和段水平的变化（称为nu和rhoSquare，分别），噪声的方差（sigmaSquare）。 rhoSquare（即要么\hat{ρ}_1^2或\hat{ρ}^2）和默认的\hat{ρ}_1^2使用。估计是有可能的选择


用法----------Usage----------



  estGlobParam(y, nu=NULL, rhoSquare=NULL, sigmaSquare=NULL, typeEstRho=1)



参数----------Arguments----------

参数：y
array containing the log2ratio of the copy number data
数组，其中包含的拷贝数数据log2ratio


参数：nu
mean of the segment levels. If nu=NULL, then the algorithm estimates it on the sample.
指段的水平。如果nu=NULL，然后算法估计样品。


参数：rhoSquare
variance of the segment levels. If rhoSquare=NULL, then the algorithm estimates it on the sample.
段水平的差异。如果rhoSquare=NULL，然后算法估计样品。


参数：sigmaSquare
variance of the noise. If sigmaSquare=NULL, then the algorithm estimates it on the sample.
噪声方差。如果sigmaSquare=NULL，然后算法估计样品。


参数：typeEstRho
choice of the estimator of rhoSquare. If typeEstRho=1, then the algorithm estimates rhoSquare  with \hat{ρ}_1^2, while if typeEstRho=0, it estimates rhoSquare with \hat{ρ}^2.
rhoSquare估计的选择。如果typeEstRho=1，然后算法估计rhoSquare用\hat{ρ}_1^2，而typeEstRho=0如果，估计rhoSquare\hat{ρ}^2。


值----------Value----------

A list containing:
一份列表，列出：


参数：<code>nu</code>

参数：<code>rhoSquare</code>

参数：<code>sigmaSquare</code>

参考文献----------References----------

Bayesian DNA copy number analysis.  BMC Bioinformatics 10: 10. http://www.idsia.ch/~paola/mBPCR  

举例----------Examples----------


##import the 10K data of cell line REC  [＃导入单元株拍摄10K数据]
data(rec10k)
##estimation of all the global parameters (the variance of the segment is estimated with \eqn{\hat{\rho}^2_1})[＃估计所有的全局参数（段的方差估计{\帽子\ EQN {\ RHO} ^ 2_1}）]
estGlobParam(rec10k$log2ratio)

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