R语言 MBCB包 mbcb.parseFile()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

mbcb.parseFile(MBCB)
mbcb.parseFile()所属R语言包：MBCB

                                        MBCB - Model-Based Background Correction for Illumina Beadarray
                                         MBCB  -  Illumina公司Beadarray基于模型的背景校正

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function is used to read the files provided into a format which will be usable by the MBCB package (data.frame).<br>
此功能用于读取的文件格式，这将是可用的MBCB包（数据框）提供参考。


用法----------Usage----------


mbcb.parseFile(sigFile, conFile, isRawBead = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：sigFile
The file-name (character string) representing the signal file.  
文件名（字符串）代表信号文件。


参数：conFile
The file-name (character string) representing the control file.  
文件名（字符串）代表控制文件。


参数：isRawBead
A boolean value representing whether the input files are bead-level or bead-type. If the input is bead-level, set this value to True so that the raw bead-level values can be summarized to bead-type data.
一个布尔值，表示是否输入文件珠或珠型。如果输入的是珠，将此值设置为True，使原料珠值可以概括珠类型的数据。


值----------Value----------

This function will return a list containing two data frames: <VAR>sig</VAR> and <VAR>con</VAR>.
此函数将返回一个列表，其中包含两个数据框：<VAR> SIG </ VAR的>和<VAR>浓度</ VAR的。




sig: Represents the signal file.
信号：表示信号文件。




con: Represents the negative control data.frame.
CON：表示阴性对照数据框。


注意----------Note----------

The input files should be tab-delimited files in the following form:<br><br> <VAR>signal.txt</VAR><br>
输入文件应该以下列形式：参考参考<VAR> signal.txt </变更>参考制表符分隔的文件


作者（S）----------Author(s)----------


Yang Xie <a href="mailto: Yang.Xie@UTSouthwestern.edu"> Yang.Xie@UTSouthwestern.edu</a>, Min Chen <a href="mailto: min.chen@phd.mccombs.utexas.edu"> min.chen@phd.mccombs.utexas.edu</a>, Jeff Allen <a href="mailto: Jeffrey.Allen@UTSouthwestern.edu"> Jeffrey.Allen@UTSouthwestern.edu</a>



参见----------See Also----------

mbcb.correct
mbcb.correct


举例----------Examples----------


  data(MBCBExpressionData)

  # Create files from the data provided in this package in the current [在当前创建此包中提供的数据文件]
  #     directory[目录]
  # Obviously, this is the opposite of what the function does, but we need to [显然，这是相反的函数做什么，但我们需要]
  #     write sample files for the sake of the demonstration[为了示范写示例文件]
  # The signal and negative control files can be used by calling the above [通过调用以上可用于信号和阴性对照文件]
  #     command without the writing and reading of the data.[没有书写和读取数据的命令。]
  write.table(expressionSignal, 'signal.txt', sep="\t");
  write.table(negativeControl, 'negative.control.txt', sep="\t");

  #read in those files just created.[在刚刚创建的文件读取。]
  data <- mbcb.parseFile('signal.txt', 'negative.control.txt');
  signal <- data$sig;
  negCon <- data$con;      

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。