R语言 MassArray包 calcPercentConversion()函数中文帮助文档(中英文对照)

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calcPercentConversion(MassArray)
calcPercentConversion()所属R语言包：MassArray

                                         Calculate percent conversion
                                         计算转化率

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to calculate percent methylation (wrapper for calcMeth() function) for each identified conversion control
计算％的甲基化（calcMeth()功能的包装，对于每一个确定的转换控制功能）


用法----------Usage----------


calcPercentConversion(fragments, peaks)



参数----------Arguments----------

参数：fragments
List of MassArrayFragment objects  
MassArrayFragment对象名单


参数：peaks
List of MassArrayPeak objects comprising spectral data to be used for conversion control calculations  
由光谱数据的MassArrayPeak对象名单将用于变频控制计算


Details

详情----------Details----------

This function serves as a wrapper function for calcMeth(), such that percent methylation is calculated for all conversion controls within the input list of fragments.
此功能为calcMeth()的包装功能服务，如％的甲基化是计算所有的转换控制内的输入列表中的片段。


值----------Value----------

Returns a list of numerical values (from 0 to 1) corresponding to percent methylation for each conversion control, with 0 Note that each element within the returned list will represent conversion control(s) for a single sample, while each element may contain multiple values with each value corresponding to data obtained from a single conversion control fragment.
返回对应％甲基对每个转换控制的数值（从0到1），0注，在返回的列表中的每个元素将代表转换控制（S）为单一样本，而每个元素可以包含多个值每个值对应获得的数据从一个单一的转换控制片段。


作者（S）----------Author(s)----------


Reid F. Thompson (<a href="mailto:rthompso@aecom.yu.edu">rthompso@aecom.yu.edu</a>), John M. Greally (<a href="mailto:jgreally@aecom.yu.edu">jgreally@aecom.yu.edu</a>)



参见----------See Also----------

See Also calcMeth, convControl
另见calcMeth，convControl


举例----------Examples----------


data(MassArray.example.data)
conversion.data <- calcPercentConversion(MassArray.example.data$fragments.T, MassArray.example.data$samples[[1]]$peaks)
mean(conversion.data)

# NOTE: conversion control data may already be contained within a MassArrayData object; these data can be accessed and visualized by the following (or alternative) commands[注：转换控制数据可能已经被载内MassArrayData对象，这些数据可以由下面的访问和可视化（或替代）的命令]
conversion.data <- unlist(lapply(lapply(MassArray.example.data$samples, slot, "quality.conversion"), median, na.rm=TRUE))
barplot(conversion.data)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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