maCompNormA(marray)
maCompNormA()所属R语言包:marray
Weights for composite normalization
重量复合标准化的
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function is used for composite normalization with intensity dependent weights. The function should be used as an argument to the main normalization function maNormMain. It only applies when two normalization procedures are combined.
此功能是用于依赖的重量与强度复合标准化。应作为主要标准化功能maNormMain参数的功能。它仅适用于当两个标准化程序相结合。
用法----------Usage----------
maCompNormA()
maCompNormEq()
值----------Value----------
A function which takes as arguments x and n, the spot average log-intensities A and the number of normalization procedures. This latter function returns a matrix of weights for combining two normalization procedures, rows correspond to spots and columns to normalization procedures. The weights for the first procedure are given by the empirical cumulative distribution function of the spot average log-intensities A. Note that when performing composite normalization as described in Yang et al. (2002), the first normalization procedure is the global fit and the second procedure is the within-print-tip-group fit.<br> <br> For maCompEq, equal weights are given for each procedure.
一个函数作为参数x和n,现货平均登陆强度和规范化的程序的数量。后者函数返回一个权重矩阵,结合两个标准化程序行对应点和列标准化程序。现货平均log强度A.注意的经验累积分布函数的第一个程序的权重,进行复合标准化时,杨等。 (2002),第一标准化过程是全球适合的第二个步骤是合适的内打印头组。参考参考maCompEq,同等重量的每一道工序。
作者(S)----------Author(s)----------
Sandrine Dudoit, <a href="http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine">http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine</a>, Yee Hwa (Jean) Yang.
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
maNormMain, maNormLoess, ecdf.
maNormMain,maNormLoess,ecdf。
举例----------Examples----------
# See examples for maNormMain[maNormMain见的例子]
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