R语言 maigesPack包 heatmapsM()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

heatmapsM(maigesPack)
heatmapsM()所属R语言包：maigesPack

                                         Function to plot heatmaps separating groups generated by SOM or k-means
                                         功能分离产生的SOM或k-均值的群体的积热图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function display individual heatmaps for each group constructed by divisive clustering techniques, like SOM or k-means. It is possible to add hierarchical dendrograms to each group individually.
此功能显示为分裂SOM或k-均值聚类技术，如修建每组单独的热图。这是可能的层次聚类添加到每个组。


用法----------Usage----------


heatmapsM(data, groups, sampleT=NULL, doHier=FALSE, distfun=dist,
          hclustfun=hclust, ...)



参数----------Arguments----------

参数：data
numeric matrix to be displayed, including all observations from all groups.
数字矩阵显示，包括从各组的所有意见。


参数：groups
numeric or character vector (with length equal to columns or rows of data) with identification of the groups to be separated. If numeric must contain the indexes and if character must contain the colnames or rownames.
鉴定组要分开的数字或字符的矢量（列或数据行长度相等）。如果数字必须包含索引，如果字符必须包含的colnames或rownames，。


参数：sampleT
list with 2 vectors, the first one specifying the first character of each sample label to be coloured according to the colours specified in the second vector.
列表2向量，第一个指定的第一个字符的每个样品的标签，是根据在第二个向量中指定的颜色的彩色。


参数：doHier
logical indicating to plot or not the hierarchical branch in the other dimension of the matrix.
逻辑表示图或没有在其他维度的矩阵的层次分支。


参数：distfun
the function to be used for distance calculation.
用于距离计算的功能。


参数：hclustfun
the function for to be used for hierarchical cluster calculation.
用于分层聚类计算的功能。


参数：...
additional parameters for image function.
image函数的附加参数。


Details

详情----------Details----------

This function is used internally by the functions hierM, somM and kmeansM. If you want to the hierarchical dendrogram in the other dimension, pay attention to the number of observations in this dimension, because the calculation of the hierarchical branch may be very time consuming!
此功能用于内部的职能hierM，somM和kmeansM。如果你想在其他维度的层次聚类分析，在这一层面的意见，注意层次分支的计算，因为可能是非常耗时！


值----------Value----------

This function display the heatmaps and don't return any object or value.
此功能显示的热图，不返回任何对象或值。


作者（S）----------Author(s)----------



Elier B. Cristo, addapted by Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参见----------See Also----------

hierM, somM, kmeansM
hierM，somM，kmeansM

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注：
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