R语言 maigesPack包 gastro()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gastro(maigesPack)
gastro()所属R语言包：maigesPack

                                         Gastro-esophagic dataset
                                         胃esophagic集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This dataset is composed of five objects of classes maigesPreRaw, maigesRaw and maiges containing a piece of the dataset that was analysed by the MAIGES (http://www.maiges.org/) and published at Cancer Research (see the reference below). In this dataset we evaluated the profiles of expression for 72 gastro-esophagical samples. Were used cDNA microarrays with slides containing 4800 spots representing approximately 4400 unique genes. The original dataset was composed from 86 samples with dye swap (what makes 172 chips). The dataset available here contain a subgroup of 20 samples (40 chips) and 500 spots (486 unique genes).
此数据集五大类的对象组成的maigesPreRaw，maigesRaw和maiges含有一块由MAIGES分析的数据集（http://www.maiges.org/~~V）在癌症研究和出版（见下面的参考）。在这一集，我们评估72肠胃esophagical的样本表达的概况。用幻灯片包含4800点代表约4400独特的基因的cDNA微阵列。来自86个样品，染料交换（什么使得172芯片）组成的原始数据集。这里提供的数据集包含了20个样本（40芯片）和500点（486独特的基因）的分组。

The objects available are: - gastro: maigesPreRaw class containing the raw dataset. - gastro.raw: maigesRaw class containing the dataset ready for filtration and normalization. - gastro.raw2: same to the above, after filtration. - gastro.norm: maiges containing the normalized data. - gastro.summ: same to the above, after summary of replicates.
可用的对象是： - gastro：maigesPreRaw类包含原始数据集。 - gastro.raw：maigesRaw类中包含的数据集过滤和规范化的准备。 - gastro.raw2：同上述，过滤后。 - gastro.norm：maiges包含规范化的数据。 - gastro.summ：同上述情况后，总结复制。


用法----------Usage----------


data(gastro)



参考文献----------References----------

R.; Martins, W.K.; Marques, S.M.; Camargo, L.P.; Brentani, H.; Pelosof, A.; Zitron, C.; Sallum, R.A.; Montagnini, A.; Soares, F.A.; Neves, E.J. & Reis, L.F. Expression Profile of Malignant and Nonmalignant Lesions of Esophagus and Stomach: Differential Activity of Functional Modules Related to Inflammation and Lipid Metabolism, Cancer Research, 65, 7127-7136, 2005 (http://cancerres.aacrjournals.org/cgi/content/abstract/65/16/7127)
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