R语言 maigesPack包 activeModScoreHTML()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

activeModScoreHTML(maigesPack)
activeModScoreHTML()所属R语言包：maigesPack

                                         Save HTML file with global gene scores from functional gene groups classification
                                         与全球基因分数从功能基因组分类保存的HTML文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes an object of class maigesActMod, that is generated using the function activeMod to do functional classification of gene groups, and save an HTML file with global score for genes separated by gene groups (modules).
此功能需要一个对象类maigesActMod，使用功能产生activeMod做基因组的功能分类，并保存HTML文件与基因分离基因组（模块）的全球得分。


用法----------Usage----------


activeModScoreHTML(mod=NULL, dir="./", fileSave="scores")



参数----------Arguments----------

参数：mod
object of class maigesActMod, resulted from functional classification of gene groups.
类对象maigesActMod，导致基因组的功能分类。


参数：dir
character string giving the folder to save the file.
字符串文件夹来保存文件。


参数：fileSave
string giving the file name. You don't need to put the extension 'html', it will be put automatically.
字符串，给出文件名。你不需要把扩展HTML，它将会自动把。


值----------Value----------

This function generates an HTML file and don't return any R value or object.
这个函数生成一个HTML文件，并且不返回任何R值或对象。


作者（S）----------Author(s)----------



Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参见----------See Also----------

plot.maigesActMod, activeMod
plot.maigesActMod，activeMod


举例----------Examples----------


## Loading a little dataset[＃载入一个小的数据集]
data(gastro)

## Doing functional classification of gene groups for 'Tissue' sample label[＃做功能分类基因组的“组织”的样本标签]
gastro.mod = activeMod(gastro.summ, sLabelID="Tissue", cutExp=1,
  cutPhiper=0.05)

activeModScoreHTML(gastro.mod)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。