bet.coinertia(made4)
bet.coinertia()所属R语言包：made4
Between class coinertia analysis
类之间coinertia分析
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Between class coinertia analysis. cia of 2 datasets where covariance between groups or classes of cases, rather than individual cases are maximised.
类之间coinertia分析。 cia2聚类体或类别的情况，而不是个别情况之间的协方差最大化。
用法----------Usage----------
bet.coinertia(df1, df2, fac1, fac2, cia.nf = 2, type = "nsc", ...)
参数----------Arguments----------
参数：df1
First dataset.A matrix, data.frame, ExpressionSet or marrayRaw-class. If the input is gene expression data in a matrix or data.frame. The rows and columns are expected to contain the variables (genes) and cases (array samples) respectively.
第一dataset.Amatrix，data.frame，ExpressionSet或marrayRaw-class。如果输入的是一个matrix或data.frame的基因表达数据。预计包含的变量（基因）和例（阵列样品）分别行和列。
参数：df2
Second dataset. A matrix, data.frame, ExpressionSet or marrayRaw-class. If the input is gene expression data in a matrix or data.frame. The rows and columns are expected to contain the variables (genes) and cases (array samples) respectively.
第二个数据集。一个matrix，data.frame，ExpressionSet或marrayRaw-class。如果输入的是一个matrix或data.frame的基因表达数据。预计包含的变量（基因）和例（阵列样品）分别行和列。
参数：fac1
A factor or vector which describes the classes in df1.
一个factor或vector这说明在DF1类。
参数：fac2
A factor or vector which describes the classes in df2.
一个factor或vector这说明在DF2类。
参数：cia.nf
Integer indicating the number of coinertia analysis axes to be saved. Default value is 2.
整数，表示要保存的一些coinertia分析轴。默认值是2。
参数：type
A character string, accepted options are type="nsc" or type="pca".
一个字符串，公认的选项类型=“国科会”或“PCA”。
参数：...
further arguments passed to or from other methods.
通过进一步的论据或其他方法。
值----------Value----------
A list of class bet.cia of length 5
一类长度为5bet.cia名单
参数：coin
An object of class 'coinertia', sub-class dudi. See coinertia
一个对象类的coinertia，子类dudi。看到coinertia
参数：coa1, pca1
An object of class 'nsc' or 'pca', with sub-class 'dudi'. See dudi, dudi.pca or dudi.nsc
一类“国科会”或“PCA”的对象，子类dudi“。看到dudi，dudi.pca或dudi.nsc
参数：coa2, pca2
An object of class 'nsc' or 'pca', with sub-class 'dudi'. See dudi, dudi.pca or dudi.nsc
一类“国科会”或“PCA”的对象，子类dudi“。看到dudi，dudi.pca或dudi.nsc
参数：bet1
An object of class 'bga', with sub-class 'dudi'. See dudi, bga or between
BGA类的对象，子类dudi“。看到dudi，bga或between
参数：bet2
An object of class 'bga', with sub-class 'dudi'. See dudi, bga or between.
BGA类的对象，子类dudi“。看到dudi，bga或between。
注意----------Note----------
This is very computational intensive. The authors of ade4 are currently re-writing the code for coinertia analysis, so that it should substantially improve the computational requirements (May 2004).
这是非常计算密集型。目前ADE4作者重新写coinertia分析代码，因此它应大幅度提高计算的要求（2004年5月）。
作者（S）----------Author(s)----------
Aedin Culhane
参考文献----------References----------
visualisation of gene expression data using co-inertia analysis. BMC Bioinformatics. 4:59
参见----------See Also----------
See Also as coinertia, cia.
另见coinertia，cia。
举例----------Examples----------
### NEED TO DO [＃需要做]
if (require(ade4, quiet = TRUE)) {}
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注：
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发表于 2012-2-25 23:59:54
