R语言 maanova包 adjPval()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

adjPval(maanova)
adjPval()所属R语言包：maanova

                                        Generate FDR adjusted P values for F test result.
                                         生成FDRF检验结果调整后的P值。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a result object from matest and calculate the FDR adjusted P values. The new P values will be appended to the input object as additional fields. It has four options;  "stepup" (Hochberg and Benjamini, 1990), "adaptive" (Benjamini and Hochberg, 2000), "stepdown" (Westfall and Young, 1993) and "jsFDR" (Storey, 2002). "jsFDR" option uses 'qvalue' package by John Storey and user suppose to install 'qvalue' package before using this option. There is no default option, thus you need to specify one option.
这个函数接受一个从matest和计算FDR校正后的P值结果对象。将追加新的P值作为附加字段输入对象。它有四个选项“升压”（Hochberg和Benjamini的，1990年），“适应性”（Benjamini和Hochberg，2000年），“降压”（西部荒野和青年，1993年）和的“jsFDR”（层，2002年） 。 “jsFDR”选项约翰层和用户想安装使用此选项之前qvalue包qvalue包。有没有默认选项，因此你需要指定一个选项。


用法----------Usage----------


adjPval(matestobj, method=c("stepup","adaptive", "stepdown", "jsFDR"))



参数----------Arguments----------

参数：matestobj
An object of class matest, which is the result from matest.
一个对象的类matest，是结果matest。


参数：method
The method for FDR control.
FDR控制方法。


值----------Value----------

An object of class matest with the following fields added for each F test:
一个类的对象matest每个F检验中增加了以下字段：


参数：adjPtab
FDR adjusted tabulated P values.
FDR校正表的P值。


参数：adjPvalperm
FDR adjusted permutation P values.
FDR校正置换P值。


作者（S）----------Author(s)----------


Hao Wu



举例----------Examples----------


data(abf1)
## Not run:  [＃无法运行：]
fit.full.simple = fitmaanova(abf1,formula = ~Strain)
# F-test strain effect[F-检验应变效应]
ftest.all = matest(abf1, fit.full.simple, term="Strain",n.perm= 1000)
# make FDR adjusted P values[FDR校正后的P值]
ftest.all = adjPval(ftest.all, 'jsFDR')
# there will be new fields in test.strain.fix after this[会有在test.strain.fix新的领域，在此之后]

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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