R语言 LVSmiRNA包 MIR-spike-in()函数中文帮助文档(中英文对照)

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MIR-spike-in(LVSmiRNA)
MIR-spike-in()所属R语言包：LVSmiRNA

                                        Data example
                                         数据的例子

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Data from a micro-RNA spike-in experiment, extracted from scanned images using Agilent Feature Extraction Software.
从数据的微RNA穗在实验中，从扫描图像使用安捷伦特征提取软件提取。


用法----------Usage----------


data("MIR-spike-in")
data("MIR_RA")



Details

详情----------Details----------

This dataset is derived from a library of synthetic RNA sequences, cor- responding to human mature miRNAs as well as in-house miRNAs with particularly similar sequences hybridized on an Agilent Human miRNA Mi- croarray 2.0. Data consist of a total of 799 miRNA species (excluding control features) for 4 samples organized in two groups A and B.
该数据集派生合成RNA序列库，肺心病，应对人类成熟的miRNA以及房子的miRNA与安捷伦人类miRNA米croarray 2.0杂交，特别是类似的序列。数据包括了799 miRNA的物种（不包括控制功能）共举办了4个样本两组，A和B。

Data, colected with the Agilent Feature Extraction Software, are stored in a RGList object with the following components:
colected安捷伦特征提取软件，数据，存储在以下组件RGList对象：

- MIR\$G:                   'gMeanSignal'   - MIR\$Gb:                   'gProcessedSignal' - MIR\$gBGMedianSignal:         'gBGMedianSignal' - MIR\$targets                       'targets' - MIR\$Row                        'Row' - MIR\$Col                        'Column' - MIR\$ProbeUID                        'Probe ID' - MIR\$genes\$ControlType                 'FLAG to specify the sort of feature' - MIR\$genes\$ProbeName                  'Probe Name' - MIR\$genes\$GeneName                  'microRNA Name' - MIR\$genes\$SystematicName                  'microRNA Name' - MIR\$genes\$Description                  'Description (not used)'
- 中红外\ $ G：“gMeanSignal” - 的miR \ $ GB：“gProcessedSignal” - 中红外\ $ gBGMedianSignal：“gBGMedianSignal” - 中红外\ $目标“目标” - 中红外\ $行“行” - 的miR \ $上校“专栏\ $ - 和平号\ $ ProbeUID探针ID“ - 的miR \ $基因的ControlType”标志来指定排序的功能“ - 的miR \ $基因\ $ ProbeName”探测器名称 - 中红外\ $基因\ $ GeneName的microRNA的名称“ - 中红外\ $基因\ $ SystematicName”microRNA的名称“ - 中红外\ $基因\ $说明”的说明（未使用）

MIR.RA holds an object of class RA obtained from using estVC on the example data.
MIR.RA持有类的对象RA使用estVC例如数据获得。


作者（S）----------Author(s)----------


Stefano Calza



参考文献----------References----------

miRNA expression analysis: Comparing microarrays with next-generation sequencing. RNA 15: 2028-2034.
GSE14511

参见----------See Also----------

read.mir, estVC
read.mir，estVC

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