smoothQuantileNormalization(lumi)
smoothQuantileNormalization()所属R语言包:lumi
Smooth quantile normalization
光滑位数标准化
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Smooth quantile normalization with a reference sample
参考样本的顺利位数标准化
用法----------Usage----------
smoothQuantileNormalization(dataMatrix, ref = NULL, adjData=NULL, logMode = TRUE, bandwidth = NULL, degree = 1, ...)
参数----------Arguments----------
参数:dataMatrix
a matrix of microarray intensity data
芯片强度数据矩阵
参数:ref
a vector of reference sample intensity, which matches the dataMatrix
参考样本强度的向量,它匹配的DataMatrix
参数:adjData
data to be adjusted based on the ref and dataMatrix distribution
ref和DataMatrix二维分布的基础上的数据进行调整
参数:logMode
whether perform the analysis in log2 scale
是否执行以log2规模的分析
参数:bandwidth
a parameter used by locpoly
locpoly使用参数
参数:degree
a parameter used by locpoly
locpoly使用参数
参数:...
other parameters used by locpoly
locpoly使用其他参数
值----------Value----------
a data matrix with intensity normalized.
与强度的数据矩阵归。
作者(S)----------Author(s)----------
Pan DU
参见----------See Also----------
See Also adjColorBias.quantile
另见adjColorBias.quantile
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注:
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