R语言 lumi包 lumiMethyB()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

lumiMethyB(lumi)
lumiMethyB()所属R语言包：lumi

                                         Adjust background level of Illumina Infinium methylation data
                                         Illumina的Infinium甲基化数据调整的背景水平

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Adjust background level of Illumina Infinium methylation data, which is an object in MethyLumiM class.
调整背景Illumina的Infinium甲基化水平的数据，这是一个MethyLumiM类的对象。


用法----------Usage----------


lumiMethyB(methyLumiM, method = c("bgAdjust2C", "forcePositive", "none"), separateColor = FALSE, verbose = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：methyLumiM
a MethyLumiM object includes Illumina Infinium methylation data
1 MethyLumiM对象包括Illumina的Infinium甲基化数据


参数：method
background adjustment methods or user provided function, whose input and output should be a intensity matrix (pool of methylated and unmethylated probe intensities)  
背景调整方法或用户提供的功能，其输入和输出应该是一个强矩阵（甲基化和甲基化的探针强度池）


参数：separateColor
determine whether to separately process two color channels
确定是否单独处理两色通道


参数：verbose
a boolean to decide whether to print out some messages  
一个布尔值，决定是否打印出一些消息


参数：...
other parameters used by corresponding method  
通过相应的方法使用的其他参数


值----------Value----------

Return an object (same class as input methyLumiM) with updated "methylated" and "unmethylated" data matrix after background level adjustment.
与更新“甲基化”和“甲基化”的数据矩阵背景水平调整后返回一个对象（输入methyLumiM同一类）。


作者（S）----------Author(s)----------



Pan DU




参见----------See Also----------

See Also bgAdjustMethylation and estimateMethylationBG
bgAdjustMethylation和estimateMethylationBG


举例----------Examples----------


data(example.lumiMethy)
lumiMethy.bgAdj = lumiB(example.lumiMethy)
attr(lumiMethy.bgAdj, "EstimatedBG")

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