IlluminaID2nuID(lumi)
IlluminaID2nuID()所属R语言包:lumi
Matching Illumina IDs to nuID based on Illumina ID mapping library
Illumina公司的ID匹配基于Illumina的ID映射库nuID
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Matching Illumina IDs to nuID based on Illumina ID mapping libraries.
Illumina的标识匹配以nuID基于Illumina的ID映射库。
用法----------Usage----------
IlluminaID2nuID(IlluminaID, lib.mapping=NULL, species = c("Human", "Mouse", "Rat", "Unknown"), chipVersion = NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数:IlluminaID
a vector of Illumina IDs
Illumina的标识向量
参数:lib.mapping
the ID mapping library. If it is provided, the parameter "species" will be ignored.
ID映射库。如果它提供的参数将被忽略“物种”。
参数:species
the species of the chip designed for. If users do not know it, it can be set as "Unknown".
设计的芯片的物种。如果用户不知道它,它可以设置为“未知”。
参数:chipVersion
chipVersion information returned by function getChipInfo
函数getChipInfo chipVersion返回的信息
参数:...
other parameters of getChipInfo
其他参数getChipInfo
Details
详情----------Details----------
When the parameter "chipVersion" is not provided, this function basically returned the "idMapping" item returned by function getChipInfo.
当参数“chipVersion”不提供这一功能基本上返回“idMapping的”项目功能getChipInfo返回的。
值----------Value----------
The mapping information from Illumina ID to nuID. It will be a matrix with each column corresponding to one matched manifest file when parameter "returnAllMatches" is TRUE. In this case, the columns are sorted from the best match to worst. If IlluminaID is NULL and chipVersion is provided, it will return all mapping information of the chip.
从Illumina的ID映射信息nuID。这将是一个矩阵每列对应一个匹配的manifest文件时参数“returnAllMatches”为TRUE。在这种情况下,列排序从最佳匹配到最差。如果IlluminaID是NULL,提供chipVersion,它会返回所有的映射信息的芯片。
作者(S)----------Author(s)----------
Pan Du
参见----------See Also----------
getChipInfo, nuID2IlluminaID
getChipInfo,nuID2IlluminaID
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注:
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