density-methods(lumi)
density-methods()所属R语言包:lumi
Density plot of a ExpressionSet object
一个ExpressionSet对象的密度图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Creating density plot of sample intensities in a ExpressionSet object. It is equivalent to hist-methods.
创建密度在ExpressionSet对象样本强度的图。它是相当于历史的方法。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'ExpressionSet'
density(x, logMode=TRUE, xlab = NULL, ylab = "density", type = "l",
col=1:dim(x)[2], lty=1:dim(x)[2], lwd=1, xlim = NULL, index.highlight = NULL, color.highlight = 2,
symmetry = NULL, addLegend = TRUE, legendPos="topright", subset = NULL, main="", ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
a ExpressionSet object
ExpressionSet对象
参数:logMode
determine whether the density plot is based on a log2 scale
确定是否密度图的基础上的log2规模
参数:xlab
xlab of the density plot
XLab中的密度图
参数:ylab
ylab of the density plot
ylab的密度图
参数:type
parameter of plot function
plot函数的参数
参数:col
line colors of the density plot
密度图的线条颜色
参数:lty
line types of the density plot
线密度图类型
参数:lwd
line width of plot function
线宽绘图功能
参数:xlim
parameter of the plot function
plot函数的参数
参数:index.highlight
the column index of the highlighted density curve
突出的密度曲线的列索引
参数:color.highlight
color of highlighted density curve
颜色强调密度曲线
参数:symmetry
the boundary position suppose to be symmetric distributed
假设是对称分布的边界位置
参数:addLegend
whether add legend to the plot or not
是否添加传奇的图或不
参数:legendPos
the legend position. It can be a string specifying the position, or a length two vector specifying the x and y position. Please check legend for more details.
传说中的位置。它可以是一个字符串,指定的位置,或指定的x和y位置的两个向量的长度。请检查legend更多细节。
参数:subset
subset of rows used to plot. It can be an index vector, or the length of a random subset
用于绘制的行子集。它可以是一个索引向量,或一个随机子集的长度
参数:main
title for the plot
图标题
参数:...
additional parameters for density function
density函数的附加参数
参见----------See Also----------
LumiBatch-class, hist-methods, density
LumiBatch-class,历史的方法,density
举例----------Examples----------
## load example data[#加载数据为例]
data(example.lumi)
density(example.lumi)
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