boxplotColorBias(lumi)
boxplotColorBias()所属R语言包:lumi
Plot the Illumina Infinium methylation color bias in terms of boxplot
盒形图的绘制Illumina的Infinium甲基化色彩偏差
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot the Illumina Infinium methylation color bias in terms of boxplot. boxplot of red and green color channel will be plotted side by side
绘制盒形图的Illumina的Infinium甲基化色彩偏差。盒形图的红色和绿色通道,将绘制并排
用法----------Usage----------
boxplotColorBias(methyLumiM, logMode = TRUE, channel = c("both", "unmethy", "methy", "sum"), grid = TRUE, main = NULL, mar = NULL, verbose = F, subset = NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数:methyLumiM
MethyLumiM-class object or eSet-class object, which include methylated and unmethylated probe intensities
MethyLumiM类对象或的ESET一流的对象,其中包括甲基化和甲基化的探针强度
参数:logMode
whether plot the intensities in log-scale
无论是图的强度,在log规模
参数:channel
estimate the intensity in different methods
不同的方法估算的强度
参数:grid
whether to add grid on the plot
对图是否添加网格
参数:main
title of the plot
图称号
参数:mar
margin of the plot
图缘
参数:verbose
whether print verbose information during plot
是否打印在图的详细信息
参数:subset
plot subset of randomly selected rows. All data will be plotted if it is NULL.
随机选择的行的积子集。如果它是NULL,所有数据都将绘制。
参数:...
other parameters of boxplot
其他参数boxplot
Details
详情----------Details----------
Plot the Illumina Infinium methylation color bias in terms of boxplot. boxplot of red and green color channel will be plotted side by side
绘制盒形图的Illumina的Infinium甲基化色彩偏差。盒形图的红色和绿色通道,将绘制并排
值----------Value----------
Invisibly return TRUE if plot successfully.
无形中如果图成功返回TRUE。
作者(S)----------Author(s)----------
Pan DU
参见----------See Also----------
See Also as boxplot and plotColorBias1D
另见boxplot和plotColorBias1D
举例----------Examples----------
data(example.lumiMethy)
boxplotColorBias(example.lumiMethy)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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