lasso.multiSplit(lol)
lasso.multiSplit()所属R语言包：lol
Multi-split lasso
多分裂套索
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Multi-split lasso as described in Meinshausen 2009
多裂套索描述2009年在Meinshausen
用法----------Usage----------
lasso.multiSplit(y, x=NULL, lambda1=NULL, nSubsampling=200, model='linear', alpha=0.05, gamma.min=0.05, gamma.max=0.95, track=FALSE, ...)
参数----------Arguments----------
参数：y
A vector of gene expression of a probe, or a list object if x is NULL. In the latter case y should a list of two components y and x, y is a vector of expression and x is a matrix containing copy number variables
一个向量基因表达的探针，或一个列表对象，如果x是NULL。在后者情况下，y应列表两部分组成Y和X，Y是一个表达向量，并拷贝数变量，x是一个矩阵
参数：x
Either a matrix containing CN variables or NULL
无论是矩阵点数变量或NULL
参数：nSubsampling
number of splits, default to 200
数分裂，默认为200
参数：model
which model to use, one of "cox", "logistic", "linear", or "poisson". Default to 'linear'
模型使用，“考克斯”，“MF”，“线性”或“泊松”。默认为“线性”
参数：alpha
specify significant level to determine the non-zero coefficients in the range of 0 and 1, default to 0.05
指定极显着水平，确定范围，默认为0和1的非零系数为0.05
参数：gamma.min
the lower bound of gamma
下界的伽玛
参数：gamma.max
the higher bound of gamma
较高的伽玛
参数：lambda1
minimum lambda to be used, if known
最低lambda来使用，如果已知
参数：track
track progress
跟踪进度
参数：...
other parameters to be passed to lass.cv
其他参数被传递到lass.cv
Details
详情----------Details----------
This function performs the multi-split lasso as proposed by Meinshausen et al. 2009. The samples are first randomly split into two disjoint sets, one of which is used to find non-zero coefficients with a regular lasso regression, then these non-zero coefficients are fitted to another sample set with OLS. The resulting p-values after multiple runs can then be aggregated using quantiles.
执行此功能的多分裂套索作为由Meinshausen等建议。 2009年。样品首先随机分裂成两个不相交的集合，其中之一是用来寻找一个普通的套索回归非零系数，那么这些非零系数安装与母机另设样品。多次运行后产生的p值，然后可以使用位数的聚合。
值----------Value----------
A list object of class 'lol', consisting of:
一类“LOL”组成，列表中的对象：
参数：beta
coefficients
系数
参数：mat
the Q_gamma matrix as described in the paper
Q_gamma矩阵中所述的文件
参数：residuals
residuals, here is only the input y
残差，这里仅是输入y
参数：pmat
the adjusted p matrix as described in the paper
调整后的p矩阵中所述的文件
作者（S）----------Author(s)----------
Yinyin Yuan
参考文献----------References----------
P-values for high-dimensional regression. Journal of the American Statistical Association, 104, 1671-1681.
参见----------See Also----------
lasso
套索
举例----------Examples----------
data(chin07)
data <- list(y=chin07$ge[1,], x=t(chin07$cn))
res <- lasso.multiSplit(data, nSubsampling=50)
res
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 23:37:10
