R语言 lol包 chin07()函数中文帮助文档(中英文对照)

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chin07(lol)
chin07()所属R语言包：lol

                                         Breast cancer data set of genome-wide copy number merged data and expression of some important genes
                                         乳腺癌全基因组拷贝数合并的数据和一些重要的基因表达数据集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A subset of breast cancer data as used in Yuan et al. (to be submitted).
乳腺癌数据的一个子集，用于在元等。 （提交）。


用法----------Usage----------


data(chin07)



格式----------Format----------

A list object of two named data matrices, cn: DNA copy number, ge: RNA expression. The matrices columns are samples and rows are probes/variables.
DNA拷贝数，GE：两个命名的数据矩阵，CN RNA表达一个列表对象。列样品和行矩阵探针/变量。


Details

详情----------Details----------

Genome-wide copy number data was merged using CGHregions resulting in 339 regions across 106 samples. Expression data are 7 probes mapped to important breast cancer genes such as CCNE2, MYC, etc, also of 106 samples.
全基因组拷贝数数据合并使用CGHregions造成339跨区域的106个样本。是映射重要CCNE2，MYC基因等，还对106个样本，如乳房癌基因的表达数据的7探针。


参考文献----------References----------

Yuan et al. (2011) Discovery and functional annotation of cis- and trans-acting DNA copy number hotspots in breast cancer, to be submitted.

举例----------Examples----------


data(chin07)
gain <- rowSums(chin07$cn >= .2)
loss <- -rowSums(chin07$cn <= -.2)
plotGW(data=cbind(gain, loss), pos=attr(chin07$cn, 'chrome'), legend=c('gain', 'loss'))

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注：
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