R语言 LMGene包 psmeans()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

psmeans(LMGene)
psmeans()所属R语言包：LMGene

                                        Function to take means of probesets.
                                         正常采取的probesets的手段。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Converts an ExpressionSet or AffyBatch object with one row of expression data per probeset into an ExpressionSet  or AffyBatch object with one row per probe.  
转换ExpressionSet或AffyBatchExpressionSet或AffyBatch每一个探测行对象一排每probeset表达数据对象。


用法----------Usage----------


psmeans(eS, ind)



参数----------Arguments----------

参数：eS
An ExpressionSet or AffyBatch object
ExpressionSet或AffyBatch对象


参数：ind
A vector used to indicate which probes go into which probesets.
probesets用来表示向量探讨。


Details

详情----------Details----------

Each entry of ind corresponds to one probe and tells the number of the probeset it belongs to.  See tranestAffyProbeLevel   and sample.ind for examples.
ind每个条目对应一个探针和讲述的probeset的它属于。为例子，请参阅tranestAffyProbeLevel和sample.ind。


值----------Value----------

Returns an ExpressionSet or AffyBatch object with the expression matrix rows corresponding to probesets instead of individual probes.  Elements of the returned ExpressionSet or AffyBatch object are means over each probeset.
返回ExpressionSet或AffyBatch表达矩阵的行对应probesets，而不是个别探针的对象。返回ExpressionSet或AffyBatch对象的元素是超过每probeset的手段。


作者（S）----------Author(s)----------


John Tillinghast



参见----------See Also----------

tranestAffyProbeLevel, sample.ind
tranestAffyProbeLevel，sample.ind


举例----------Examples----------


library(LMGene)
library(Biobase)

data(sample.eS)
data(sample.ind)

# glog transform data[glog变换数据]
trs.eS <- transeS (sample.eS, 667, 65)

# lowess normalize[LOWESS标准化]
ntrs.eS <- lnormeS(trs.eS)

# take means over probesets[接管probesets手段]
genesample.eS<- psmeans (ntrs.eS, sample.ind)

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