tmixture(limma)
tmixture()所属R语言包:limma
Estimate Scale Factor in Mixture of t-Distributions
估计在T-分布的混合比例因子
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function estimates the unscaled standard deviation of the log fold change for differentially expressed genes. It is called by the function ebayes and is not intended to be called by users.
这个函数估计倍差异表达基因的变化log的非标度的标准偏差。这就是所谓的功能ebayes“不打算由用户调用。
用法----------Usage----------
tmixture.vector(tstat,stdev.unscaled,df,proportion,v0.lim=NULL)
tmixture.matrix(tstat,stdev.unscaled,df,proportion,v0.lim=NULL)
参数----------Arguments----------
参数:tstat
numeric vector or matrix of t-statistics
t-统计的数字向量或矩阵
参数:stdev.unscaled
numeric matrix conformal with tstatf containing the unscaled standard deviations for the coefficient estimators
数字矩阵形与tstatf含有非标度系数估计的标准偏差
参数:df
numeric vector giving the degrees of freedom associated with tstat
数字向量给予的自由和tstat关联度
参数:proportion
assumed proportion of genes which are differentially expressed
这些差异表达基因的假设比例
参数:v0.lim
numeric vector of length 2, assumed lower and upper limits for the estimated unscaled standard deviation
向量长度为2的数字,假设估计的非标度的标准差的上限和下限
Details
详情----------Details----------
The values in each column of tstat are assumed to follow a mixture of an ordinary t-distribution, with mixing proportion 1-proportion, and (v0+v1)/v1 times a t-distribution, with mixing proportion proportion. Here v1=stdev.unscaled^2 and v0 is the value to be estimated.
在每个tstat列的值被假定遵循一个普通的t-分布的混合物,混合比例1-proportion,(v0+v1)/v1次T-混合比例分配,proportion。这里v1=stdev.unscaled^2和v0是估计值。
值----------Value----------
Numeric vector of length equal to the number of columns of tstat and stdev.unscaled.
数字矢量长度等于tstat和stdev.unscaled列数。
作者(S)----------Author(s)----------
Gordon Smyth
参见----------See Also----------
ebayes
ebayes
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注:
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