R语言 limma包 readTargets()函数中文帮助文档(中英文对照)

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readTargets(limma)
readTargets()所属R语言包：limma

                                        Read Targets File
                                         读取目标文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read targets file for a microarray experiment into a dataframe.
阅读一成dataframe芯片实验的目标文件。


用法----------Usage----------


readTargets(file="Targets.txt", path=NULL, sep="\t", row.names=NULL, quote="\"",...)



参数----------Arguments----------

参数：file
character string giving the name of the targets file.
字符串的目标文件的名称。


参数：path
character string giving the directory containing the file. Can be omitted if the file is in the current working irectory.  
字符串，包含文件的目录。如果该文件是在当前的工作irectory可以省略。


参数：sep
field separator character
字段分隔符


参数：row.names
character string giving the name of a column from which to obtain row names
列名的字符串从中获取行名称


参数：quote
the set of quoting characters
引用字符集


参数：...
other arguments are passed to read.table
其他的参数被传递read.table


Details

详情----------Details----------

The targets file is a text file containing information about the RNA samples used as targets in the microarray experiment. Rows correspond to arrays and columns to covariates associated with the targets. For a two-color experiment, the targets file will normally include columns labelled Cy3 and Cy5 or similar specifying which RNA samples are hybridized to each channel of each array. Other columns may contain any other covariate information associated with the arrays or targets used in the experiment.
目标文件是一个文本文件包含在芯片实验的目标所使用的RNA样品的信息。行对应与目标相关的协变量阵列和列。对于两色的实验中，目标文件通常会包含列标记为Cy3和Cy5或类似指定RNA样品杂交，每个阵列的每个通道。其他列可能包含任何其他协与实验中所用的阵列或目标相关的信息。

If row.names is non-null and there is a column by that name with unique values, then those values will be used as row names for the dataframe. If row.names is null, then the column Labels will be used if such exists or, failing that, the column FileName.
如果row.names非空，并有一个列名，具有独特的价值，然后将这些值作为行名称为dataframe。 row.names如果是空的，然后列Labels将用于如存在，或做不到这一点，列FileName。

See the Limma User's Guide for examples of this function.
这个函数的例子参见的Limma用户指南。


值----------Value----------

A dataframe. Character columns are not converted into factors.
一个dataframe。字符列转换成因素。


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth



参见----------See Also----------

An overview of LIMMA functions for reading data is given in 03.ReadingData.
在03.ReadingData一个读取数据LIMMA功能的概述。

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