R语言 lapmix包 laptopTable()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

laptopTable(lapmix)
laptopTable()所属R语言包：lapmix

                                        Table of Top Genes from Laplace Linear Model Fit
                                         从拉普拉斯线性模型拟合的热门基因的表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extract a table of the top-ranked genes from a Laplace mixture model fit.
提取表从一个的拉普拉斯混合模型拟合的世界排名第一的基因。


用法----------Usage----------


laptopTable(res, number=res$med.number, sort.by='L')



参数----------Arguments----------

参数：res
the output from the lapmix.Fit routine
从lapmix.Fit例行的输出


参数：number
how many genes to pick out; if missing: number is determined by the median rule
多少基因挑出来，如果缺少：数中位数规则确定


参数：sort.by
character string specifying statistic to sort the selected genes by in the output data.frame.
字符串指定的统计，在输出数据框选定的基因排序。


Details

详情----------Details----------

This function summarizes a Laplace mixture model fit object produced by lapmix.Fit by selecting the top-ranked genes according to the posterior log-odds or M-values.
此功能总结lapmix.Fit选择排名第一的基因后的log赔率或M值产生拉普拉斯混合模型拟合对象。

The sort.by argument specifies the criterion used to select the top genes. Only two choices at the moment: "M" to sort by the (absolute) coefficient representing the log-fold-change, and "L" to sort by the posterior odds of differential expression under the Laplace mixture model.
sort.by参数指定使用的标准，选择顶部的基因。目前只有两个选择："M"（绝对）代表log倍变化系数进行排序，"L"根据拉普拉斯混合模型后差异表达的赔率排序。


值----------Value----------

A dataframe with a row for the number top genes and the following columns:
与number顶级基因和后列的行dataframe：


参数：M
average log fold change
平均log倍的变化


参数：log.odds
log posterior odds that the gene is differentially expressed
登录后的赔率，该基因的差异表达


作者（S）----------Author(s)----------


Yann Ruffieux



举例----------Examples----------


#  See lapmix.Fit example[见lapmix.Fit例如]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。