getSnpInfo(ITALICS)
getSnpInfo()所属R语言包:ITALICS
Function to retrieve the chromosome and the position of each SNP on a given Affymetrix SNP array
函数来检索一个给定的Affymetrix公司的SNP阵列的染色体,每个SNP的位置
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function retrieve the chromosome and position in bp of each SNP of a given Affymetrix SNP array. This function use the pd.mapping50k.xba240, pd.mapping50k.hind240, pd.mapping250k.sty and pd.mapping250k.nsp package.
这个函数检索在每一个给定的Affymetrix公司的SNP阵列SNP BP染色体和位置。功能使用pd.mapping50k.xba240,pd.mapping50k.hind240,pd.mapping250k.sty和pd.mapping250k.nsp包。
用法----------Usage----------
getSnpInfo(pkgname)
参数----------Arguments----------
参数:pkgname
the chip type pd.mapping50k.xba240, pd.mapping50k.hind240, pd.mapping250k.sty or pd.mapping250k.nsp
芯片类型pd.mapping50k.xba240,pd.mapping50k.hind240,pd.mapping250k.sty或pd.mapping250k.nsp
值----------Value----------
Return a data.frame with five columns : fsetid, dbsnp_rs_id, Chr, X and fragment_length corresponding to the fsetid, the rs_id, the chromosome, the position on the chromosome and the PCR amplified fragment length respectively.
返回有五列数据框:fsetid,dbsnp_rs_id,CHR,X和fragment_length相应的fsetid,rs_id,染色体,在染色体上的位置和PCR扩增片段长度分别为。
注意----------Note----------
People interested in tools dealing with array CGH analysis and DNA copy number analysis can
阵列比较基因组杂交分析和DNA拷贝数的分析与处理工具有兴趣的人可以
作者(S)----------Author(s)----------
Guillem Rigaill, <a href="mailto:italics@curie.fr">italics@curie.fr</a>.
源----------Source----------
Institut Curie, italics@curie.fr.
居里研究所,italics@curie.fr。
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注:
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