getQuartet(ITALICS)
getQuartet()所属R语言包:ITALICS
Function to retrieve the information of each quartet
函数来检索信息的每个四重奏
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function retrieve information of each quartet. This function use the pd.mapping50k.xba240, pd.mapping50k.hind240, pd.mapping250k.sty and pd.mapping250k.nsp package.
这个函数检索每个四方的信息。功能使用pd.mapping50k.xba240,pd.mapping50k.hind240,pd.mapping250k.sty和pd.mapping250k.nsp包。
用法----------Usage----------
getQuartet(pkgname, snpInfo)
参数----------Arguments----------
参数:pkgname
the chip type pd.mapping50k.xba240, pd.mapping50k.hind240, pd.mapping250k.sty or pd.mapping250k.nsp
芯片类型pd.mapping50k.xba240,pd.mapping50k.hind240,pd.mapping250k.sty或pd.mapping250k.nsp
参数:snpInfo
a data frame containing SNPs position along the genome
一个数据框包含沿基因组SNP的位置
值----------Value----------
return a list with two fields. fid : containing the position of each quartet on the CEL file. quartetInfo : a data fame containing the columns : fsetid, fid, FL (fragment length) and GC (content of the quartet)
与两个字段返回一个列表。 FID:为CEL文件包含每个四方的位置。 quartetInfo:列数据名利:fsetid,FID,FL(片段长度)和GC(四方的内容)
注意----------Note----------
People interested in tools dealing with array CGH analysis and DNA copy number analysis can
阵列比较基因组杂交分析和DNA拷贝数的分析与处理工具有兴趣的人可以
作者(S)----------Author(s)----------
Guillem Rigaill, <a href="mailto:italics@curie.fr">italics@curie.fr</a>.
源----------Source----------
Institut Curie, italics@curie.fr.
居里研究所,italics@curie.fr。
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注:
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