buildIonTree(iontree)
buildIonTree()所属R语言包:iontree
Build ion tree
建立离子树
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
build an ion tree derived from the specified m/z and RT ranges in one sample based on ms2 and ms3 raw data, see saveMSnRaw and hasMS2.
建立从指定的m / z和RT MS2和MS3原始数据的一个样本范围的离子树,看到saveMSnRaw和hasMS2。
用法----------Usage----------
buildIonTree(mzRange = c(340.5, 341.5), rtRange = c(270, 282), ms2, ms3)
参数----------Arguments----------
参数:mzRange
mz range
MZ范围
参数:rtRange
rt range
RT范围
参数:ms2
ms2 data as list
MS2数据作为列表
参数:ms3
ms3 data as list
MS3数据作为列表
注意----------Note----------
the full time range is used for direct infusion mass spectrometry. For instance, rtRange=c(0, 300) is used for 5-min total elution time.
用于直接注入质谱充分的时间范围。例如,rtRange = C(0,300)总洗脱时间为5分钟。
作者(S)----------Author(s)----------
Mingshu Cao
举例----------Examples----------
#mz=867 [MZ = 867]
#mzDelta=0.5[mzDelta = 0.5]
#mzRange=c(mz-mzDelta, mz+mzDelta)[:mzRange = C(MZ-mzDelta,MZ + mzDelta)]
#rtRange=c(1, 600) [rtRange = C(1,600)]
#hasMS2(MS2RAW, mzRange=c(mz-mzDelta, mz+mzDelta), rtRange=c(0, 600)) [hasMS2(MS2RAW,mzRange = C(MZ-mzDelta MZ + mzDelta),rtRange = C(0,600))]
#idx.ms2=1[idx.ms2 = 1]
#ms2=MS2RAW[[idx.ms2]][MS2 = MS2RAW [[idx.ms2]]
#ms3=MS3RAW[[idx.ms2]][MS3 = MS3RAW [[idx.ms2]]
#tree1=buildIonTree(mzRange, rtRange=c(0, 600), ms2, ms3)[树1 = buildIonTree(mzRange,rtRange = C(0,600),MS2,MS3)]
#plot(tree1) [图(树1)]
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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