getInv-methods(inveRsion)
getInv-methods()所属R语言包:inveRsion
gets "scan" into a matrix
进入矩阵“扫描”
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Each row of the matrix represents a trial segment of fixed window size, for which the inversion model has been fit. It lists the left and right brake-points and output of the fitting: Log-likelihood ratio, probability of inversion, entropy, BIC (Bayes Information Criterion) and number of haplotypes.
矩阵的每一行代表一个固定的窗口大小的试验段,已适应反演模型。它列出了左,右制动点和输出配件:数似然比,反转的概率,熵的BIC(贝叶斯信息准则)和单倍型的数量。
用法----------Usage----------
getInv(object, thBic, rnd, Like)
参数----------Arguments----------
参数:object
scan. Cromosome scanned for inversions with trial segments of fixed window size.
scan。 cromosome扫描与固定窗口大小的试验段为倒。
参数:thBic
numeric. BIC threshold above which data is retrieved.
numeric。 BIC的阈值,上述数据检索。
参数:rnd
logic. Whether round matrix elements.
logic。是否全面的矩阵元素。
参数:Like
numeric. Log-likelihood ratio threshold above which data is retrieved.
numeric。数似然比阈值以上的数据检索。
Details
详情----------Details----------
Matrix with output of scanInv. Each row corresponds to a trail segments with given brake points and significance measures for the inversion model.
矩阵scanInv输出。每一行对应一条小道分部反演模型与刹车点和意义的措施。
值----------Value----------
matrix.
matrix。
方法----------Methods----------
signature(object = "scan") returns matrix with output of inversion model for each trial segment
signature(object = "scan")返回每个试验段的矩阵反演模型的输出
举例----------Examples----------
data(scanRes)
a<-getInv(scanRes,thBic=2500)
a
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注:
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