R语言 inSilicoDb包 getDatasets()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getDatasets(inSilicoDb)
getDatasets()所属R语言包：inSilicoDb

                                        Get datasets in ExpressionSet format
                                         获取ExpressionSet格式的数据集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Get datasets (a 'series' object in Gene Expression Omnibus terminology) for a given series GSE identifier for every platform it contains
对于一个给定的每一个平台，它包含一系列GSE标识符获取数据集（“系列基因表达的综合术语的对象）


用法----------Usage----------


getDatasets(gse, norm="ORIGINAL", genes=FALSE);



参数----------Arguments----------

参数：gse
Valid series GSE identifier.
有效一系列GSE标识符。


参数：norm
Required preprocessing method. Currently available options are ORIGINAL and FRMA. The ORIGINAL normalization is how the original authors submitted it to Gene Expression Omnibus (GEO). This data is always available and is therefore the default option. The availability of FRMA normalization depends on the availability of the CEL files by the original authors.
需要预处理方法。目前可用的选项是原始和FRMA的。原标准化是原作者如何提交基因表达的综合“（GEO）。这个数据始终是可用的，因此是默认选项。 FRMA标准化的可用性取决于原作者CEL文件的可用性。


参数：genes
By default a gene expression matrix containing probes is returned. Precomputed conversions using genes instead of probes are also available if this argument is set to TRUE. This conversion was made using the nsFilter function from Bioconductors genefilter package.
默认情况下，基因表达矩阵包含探针返回。如果该参数设置为TRUE，也可预先计算转换的探针，而不是使用基因。这种转换使用BioconductorsnsFilter包genefilter功能。


值----------Value----------

A list with a Bioconductors ExpressionSet for every platform
一个对每个平台的列表与Bioconductors ExpressionSet


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
  getPlatforms("GSE781");
  ## [1] "GPL96" "GPL97"[＃[1]“GPL96”GPL97“]
  esets = getDatasets("GSE781");
  sapply(esets, annotation)
  ## [1] "hgu133a" "hgu133b"[＃[1]“hgu133a”hgu133b“]


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。