R语言 htSeqTools包 coverageDiff()函数中文帮助文档(中英文对照)

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coverageDiff(htSeqTools)
coverageDiff()所属R语言包：htSeqTools

                                        Compute the difference in coverage between two objects
                                         计算两个对象之间的区别在覆盖

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computes coverage of sample1 minus coverage of sample2, taking into account that the chromosomes in sample1 and sample2 are not necessarily the same.
计算的SAMPLE1减去的sample2覆盖的覆盖面，同时考虑到，在SAMPLE1的sample2染色体不一定相同。


用法----------Usage----------


coverageDiff(sample1, sample2, chrLength)



参数----------Arguments----------

参数：sample1
Object with reads from sample 1. Typically, a RangedData object.
从样品1对象与内容。通常，一个RangedData对象。


参数：sample2
Object with reads from sample 2. Typically, a RangedData object.
对象与读取样品2。通常，一个RangedData对象。


参数：chrLength
Named vector with chromosome lengths. This can be obtained from the Bioconductor annotation packages, e.g. BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3 for drosophila melanogaster, etc.
命名为染色体长度的向量。这可从的的Bioconductor注解包，如BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3果蝇等。


Details

详情----------Details----------

Computation is restricted to chromosomes in names(chrLength).
计算仅限于染色体中names(chrLength)。


值----------Value----------

SimpleRleList with differences in coverage.
SimpleRleList覆盖面的差异。


举例----------Examples----------


sample1 <- RangedData(IRanges(1:10,11:20),space='chr1')
sample2 <- RangedData(IRanges(1:10,11:20),space=rep(c('chr1','chr2'),each=5))
chrLength <- c(50,25); names(chrLength) <- c('chr1','chr2')
coverageDiff(sample1,sample2,chrLength)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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