R语言 htSeqTools包 cmdsFit()函数中文帮助文档(中英文对照)

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cmdsFit(htSeqTools)
cmdsFit()所属R语言包：htSeqTools

                                        Classical Multi-Dimensional Scaling for a distance matrix
                                         经典的多维尺度的距离矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

cmdsFit obtains coordinates in a k dimensional space which best approximate the given distances between objects.
cmdsFit获得一个k三维空间中的坐标最佳逼近给定的对象之间的距离。


用法----------Usage----------


cmdsFit(d, k=2, type='classic', add=FALSE, cor.method='pearson')



参数----------Arguments----------

参数：d
Distances between objects
之间的距离对象


参数：k
Dimensionality of the reconstructed space, typically set to 2 or 3.
重建的空间维度，通常设置为2或3。


参数：type
Set to "classic" to perform classical MDS (uses function cmdscale from package stats). Set to "isoMDS" to use Kruskal's non-metric MDS (uses function isoMDS from package MASS).  
设置为"classic"执行经典的MDS（使用函数cmdscale包stats）。设置为"isoMDS"使用克鲁斯卡的非度量MDS（使用函数isoMDS包MASS）。


参数：add
Logical indicating if an additive constant c* should be computed, and added to the non-diagonal dissimilarities such that all n-1 eigenvalues are non-negative in cmdscale  
逻辑表明添加剂常数c *应计算，添加非对角线的异同等，所有的n-1的特征值非负cmdscale


参数：cor.method
A character string indicating which correlation coefficient (or covariance) is to be computed.  One of "pearson" (default), "kendall", or "spearman", can be abbreviated. </table>
要计算一个字符串，指示哪些相关系数（或协方差）。 “皮尔森”（默认），“肯德尔”，或“矛”，都可以缩写。 </ TABLE>


值----------Value----------

The function returns a cmdsFit object. See help("cmdsFit-class") for details.
该函数返回一个cmdsFit对象。有关详细信息，请参阅帮助（的“cmdsFit级”）。


方法----------Methods----------




signature(d = "matrix")  Use Classical Multi-Dimensional Scaling to represent points
signature(d = "matrix")使用古典的多维尺度来表示点


举例----------Examples----------


### Not run[＃无法运行]
#d &lt;- matrix(c(0,5,10,5,0,15,10,15,0),byrow=TRUE,ncol=3)[D < - 矩阵（C“（0,5,10,5,0,15,10,15,0），byrow = TRUE，NCOL = 3）]
#cmdsFit(d,add=TRUE)[cmdsFit（D，附加= TRUE时）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。