viewSubNet(HTSanalyzeR)
viewSubNet()所属R语言包：HTSanalyzeR
Plot a figure of the enriched subnetwork
画出图富集子网
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This is an generic function.
这是一个通用的功能。
When implemented as the S4 method of class NWA, this function invokes the function networkPlot to plot the subnetwork identified by the 'BioNet' package.
当实施S4方法类NWA，这个函数调用函数networkPlot绘制“生物网”方案所确定的子网。
用法----------Usage----------
viewSubNet(object)
参数----------Arguments----------
参数：object
an object. When implemented as S4 methods of class NWA, this argument is an object of class 'GSCA'.
一个对象。当为S4类方法实现NWA，这种说法是一个类的GSCA的对象。
Details
详情----------Details----------
After the analyses step for an object of class NWA, the user can generate the enriched subnetwork identified by the package 'BioNet'. If the slot 'phenotype' was inputted during the initialization of the object, this function will send it to the function networkPlot as the argument 'phenotypeVector' to highlight nodes in different colors. If the argument 'species' of the function analyze has been assigned, the labels of the nodes of this subnetwork will be mapped to gene symbols corresponding to the species; otherwise, the Entrez identifiers will be used as the labels.
类对象的分析步骤后NWA，用户可以生成丰富的子网确定包“生物网”。如果槽“型”输入对象的初始化过程中，这个函数将它发送到函数networkPlot参数phenotypeVector以不同颜色突出节点。如果参数种的功能analyze已分配子网节点的标签将被映射到相应的物种的基因符号，否则，将作为标签使用Entrez的标识符。
作者（S）----------Author(s)----------
Xin Wang <a href="mailto:xw264@cam.ac.uk">xw264@cam.ac.uk</a>
参见----------See Also----------
networkPlot, analyze, plotSubNet
networkPlot，analyze，plotSubNet
举例----------Examples----------
## Not run: [＃无法运行：]
##load sample data[＃加载样本数据。]
data("KcViab_NWA")
##plot to screen the identified subnetwork[＃绘制筛选确定的子网]
viewSubNet(KcViab_NWA)
## End(Not run)[＃结束（不运行）]
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-25 22:00:27
