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R语言 HTSanalyzeR包 KeggGeneSets()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 21:57:04 | 显示全部楼层 |阅读模式
KeggGeneSets(HTSanalyzeR)
KeggGeneSets()所属R语言包:HTSanalyzeR

                                         Create a list of gene sets based on KEGG pathways terms
                                         KEGG通路条款的基础上,创建一个基因集的列表

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function creates a list of gene sets based on KEGG pathways terms.  It is species-specific, and returns a list of gene sets, each of which  is a character vector of Entrez gene identifiers.
这个函数创建一个KEGG通路条款的基础上的基因集的列表。它是特定物种,并返回一个基因组的列表,其中每个是Entrez基因标识符的字符向量。


用法----------Usage----------


KeggGeneSets(species="Dm")



参数----------Arguments----------

参数:species
a single character value specifying the species: "Dm" ("Drosophila_ melanogaster"), "Hs" ("Homo_sapiens"), "Rn" ("Rattus_norvegicus"), "Mm" ("Mus_musculus") or "Ce" ("Caenorhabditis_elegans"))  
一个单一的字符值,指定的种类:“DM”(“Drosophila_果蝇”),“HS”(“Homo_sapiens”),“RN”(的“Rattus_norvegicus”),“MM”(“Mus_musculus” ;)或“CE”(“Caenorhabditis_elegans”))


Details

详情----------Details----------

This function relies on the following packages: GSEABase, KEGG.db.
此功能依赖于下面的软件包:GSEABase,KEGG.db.


值----------Value----------

a list of gene sets, with names as KEGG pathway IDs. Each gene set  is a character vector of Entrez gene identifiers.
的基因集的列表,如KEGG通路ID的名称。每个基因组的Entrez基因识别的特征向量。


作者(S)----------Author(s)----------



Camille Terfve, Xin Wang




参见----------See Also----------

GOGeneSets
GOGeneSets


举例----------Examples----------


library(org.Dm.eg.db)
library(KEGG.db)
DM_KEGG<-KeggGeneSets(species = "Dm")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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