R语言 HTqPCR包 plotCVBoxes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotCVBoxes(HTqPCR)
plotCVBoxes()所属R语言包：HTqPCR

                                        Boxplots of CV for qPCR Ct values.
                                         盒状图定量PCR的Ct值的CV。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function that will calculate the coefficients of variation across selected qPCR data, and plot the results in a boxplot.
功能，将在选定的qPCR数据计算变异系数，并绘制盒形图的结果。


用法----------Usage----------


plotCVBoxes(q, cards = TRUE, xlab = "", ylab = "CV", col = brewer.pal(5, "Spectral"), main = NULL, stratify, ...)



参数----------Arguments----------

参数：q
object of class qPCRset.
对象类qPCRset。


参数：cards
vector, the numbers of the cards to plot. Defaults to TRUE = all cards.
向量，卡的数量来绘制。默认为TRUE =所有卡片。


参数：xlab
character string, label for the x-axis.
字符串，x轴的标签。


参数：ylab
character string, label for the y-axis.
字符串，y轴的标签。


参数：col
vector of colours to use.
向量使用的颜色。


参数：main
character string, plot title.
字符串，小区称号。


参数：stratify
character, specifying what to stratify the Ct values by. NULL, the default means no stratification, "type" is the feature types of the qPCRset, and "class" the feature class.
字符，指定什么分层Ct值。 NULL，则默认情况下是指无分层，“型”特征类型的qPCRset，“下课”的要素类。


参数：...
any other arguments will be passed to the boxplot function.
任何其他参数将被传递给boxplot功能。


Details

详情----------Details----------

The CV is calculated across all the selected cards based on each well position, without taking possibly replicated genes on the cards into consideration. "type" and "class" are automaticalle extracted from the qPCRset using featureType and featureClass.
CV计算各地根据每口井的位置，所有选定的卡，卡上没有采取考虑到可能复制的基因。 “类型”和“类”automaticalle提取使用featureType和featureClassqPCRset。


值----------Value----------

A plot is created on the current graphics device. The CV values are returned invisibly.
当前图形设备上创建一个图。无形的CV值返回。


作者（S）----------Author(s)----------


Heidi Dvinge



参见----------See Also----------

boxplot
boxplot


举例----------Examples----------


# Load example data[加载示例数据]
data(qPCRraw)
# Make plot with all samples or just a few[所有样品图或少数几个]
plotCVBoxes(qPCRraw)
plotCVBoxes(qPCRraw, cards=c(1,4))
plotCVBoxes(qPCRraw, stratify="class")
x        <- plotCVBoxes(qPCRraw, stratify="type")
x[1:10]

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