R语言 GWASTools包 qqPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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qqPlot(GWASTools)
qqPlot()所属R语言包：GWASTools

                                        QQ plot for genome wide assocation studies
                                         QQ基因组的广泛assocation研究积

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generates a Quantile-Quantile plot for -log10 p-values from genome wide association tests.
生成为LOG10 p值从全基因组关联测试的位数，位数图。


用法----------Usage----------


qqPlot(pval, truncate = FALSE, sub = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：pval
Vector of p-values  
矢量p-值


参数：truncate
A logical value indicating whether the y-axis should be truncted to the same range as the x-axis.  
一个逻辑值，指明是否为x轴y轴应truncted相同的范围。


参数：sub
A character string to print under the x-axis.
一个字符串打印在X轴。


参数：...
Other parameters to be passed directly to plot.
其他参数将直接传递到plot。


Details

详情----------Details----------

The function generates a Quantile-Quantile plot of p-values on a -log10 scale, with the option of truncating the y-axis to the range of the x-axis (0, -log10(1/length(pval)).  If the y-axis is truncated,  then points off the top of the plot are denoted by triangles at the upper edge.   The 95% confidence interval is shaded in gray.
上LOG10规模函数生成的p-值的位数，位数图，截断范围x轴(0, -log10(1/length(pval))y轴的选项。如果y轴被截断，然后点关闭顶部的图是由三角形表示在上部边缘。 95％的置信区间是灰色的阴影。

If sub=NULL (the default), the genomic inflation factor lambda is calculated from the p-values and printed.
如果sub=NULL（默认），基因组的通胀因素的lambda p值计算和打印。


作者（S）----------Author(s)----------


Cathy Laurie, Matt Conomos




举例----------Examples----------


pvals <- seq(0, 1, 0.001)
qqPlot(pvals)

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注：
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