R语言 GRENITS包 mcmc.defaultParams_Linear()函数中文帮助文档(中英文对照)

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mcmc.defaultParams_Linear(GRENITS)
mcmc.defaultParams_Linear()所属R语言包：GRENITS

                                        Default Parameters for Linear Model
                                         线性模型的默认参数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create parameter vector with default parameters for LinearNet function
创建具有默认参数LinearNet功能参数向量


用法----------Usage----------


mcmc.defaultParams_Linear()



Details

详情----------Details----------

Use this function to generate a template parameter vector to use non-default parameters for  the LinearNet model.
使用此功能来生成一个模板参数向量使用非默认为LinearNet模型参数。


值----------Value----------

Returns a single vector with the following elements (in this order):
一个向量返回与下列元素（按此顺序）：


参数：(1) samples
Number of MCMC iterations to run.
数量的MCMC迭代运行。


参数：(2) burn.in
Number of initial iterations to discard as burn in.
初始迭代的数量，放弃烧英寸


参数：(3) thin
Subsampling frequency
欠采样频率


参数：(4) c
Shape parameter 1 for Beta(c,d) prior on rho (connectivity parameter)
形状参数1β（C，D）前对RHO（连通参数）


参数：(5) d
Shape parameter 2 for Beta(c,d) prior on rho (connectivity parameter)
形状参数β（C，D）2前对RHO（连通参数）


参数：(6) sigma.s
Standard deviation parameter for N(0,sigma.s) prior on B (Regression coefficients)
标准偏差参数为N（0，sigma.s）前对B（回归系数）


参数：(7) a
Shape parameter for Gamma(a,b) prior on lambda (Regression precision)  
形状参数的伽玛（A，B）之前的lambda（回归精度）


参数：(8) b
Rate parameter for Gamma(a,b) prior on lambda (Regression precision)  
伽马率参数（A，B）之前，在λ（回归精度）


参数：(9) sigma.mu
Standard deviation parameter for N(0,sigma.mu) prior on mu (Regression intercept)
标准偏差参数为N（0，sigma.mu）前亩（回归截距）


参考文献----------References----------

networks using time course data with repeated measurements.  Bioinformatics 2010; doi: 10.1093/bioinformatics/btq421
topology of a nonlinear sparse gene regulatory network using fully Bayesian spline autoregression Biostatistics 2011; doi: 10.1093/biostatistics/kxr009

参见----------See Also----------

plotPriors, LinearNet.
plotPriors，LinearNet。


举例----------Examples----------


    # Get default parameters[获取默认参数]
    linearNet.params <- mcmc.defaultParams_Linear()

    # Change run length[变更运行长度]
    linearNet.params[1] <- 150000

    # Change prior regression precision [改变之前回归精度]
    linearNet.params[7] <- 0.001
    linearNet.params[8] <- 0.001

    # Plot to check changes[图检查更改]
    plotPriors(linearNet.params)

    ## Use to run LinearNet ...[＃使用运行LinearNet ...]

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