cellcycle(GraphAT)
cellcycle()所属R语言包:GraphAT
Cell-Cycle Cluster Matrix
单元周期聚类矩阵
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
An adjacency matrix in which
邻接矩阵
用法----------Usage----------
data(ccCM)
格式----------Format----------
ccCM is a symmetric matrix with 2885 columns and 2885 rows.
ccCM是一个有2885列和2885行对称矩阵。
nNamescc is a vector of 2885 gene names.
nNamescc是2885基因名称的向量。
Details
详情----------Details----------
Cho, et al. discuss the k means clustering of 2885 Saccharomyces genes into 30 clusters with measurements taken over two synchronized cell cycles. nNamescc is a vector of the 2885 gene names. ccCM is an adjacency matrix in which a "1" in the ith row and jth column indicates that gene i and gene j belong to the same cluster. All other entries are 0. These data are integrated with phenotypic data and GO data in Balasubramanian, et al (2004).
町等。讨论的k是指超过两个同步单元周期的测量到30簇2885酵母基因的聚类。 nNamescc2885基因名称是一个向量。 ccCM是一个邻接矩阵,其中一个“1”的第i行第j列表示基因i和j基因属于同一聚类。所有其他项均为0。这些数据与表型数据和满足今后等(2004)Go数据集成。
源----------Source----------
Balasubramanian R, LaFramboise T, Scholtens D, Gentleman R. (2004) A graph theoretic approach to integromics - integrating disparate sources of functional genomics data
满足今后ŕ,LaFramboiseţ,Scholtens D,君子R.(2004)一个图形理论方法integromics - 整合功能基因组数据的不同来源
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
data(ccCM)
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注:
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