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R语言 GraphAlignment包 ComputeNodeParameters()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 20:59:10 | 显示全部楼层 |阅读模式
ComputeNodeParameters(GraphAlignment)
ComputeNodeParameters()所属R语言包:GraphAlignment

                                        Compute node parameters
                                         计算节点参数

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Compute the optimal scoring parameters (node score) for a given alignment.
计算一个给定的对齐的最佳得分参数(节点分)。


用法----------Usage----------


ComputeNodeParameters(dimA, dimB, R, P, lookupNode, clamp=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:dimA
size of network A
网络的大小


参数:dimB
size of network B
网络B的大小


参数:R
node similarity score matrix
节点的相似性得分矩阵


参数:P
permutation vector (see InitialAlignment, AlignNetworks)
置换向量(见InitialAlignment,AlignNetworks)


参数:lookupNode
node bin lookup table (see GetBinNumber)
节点槽查找表(见GetBinNumber)


参数:clamp
clamp values to range when performing bin lookups
钳位值范围时执行的bin查找


Details

详情----------Details----------

This function computes optimal node score parameters for use with ComputeM and AlignNetworks. It takes the size of the networks, a matrix of node similarities R, an initial alignment P, and the lookup table for node binning, lookupNode, as parameters.
此函数计算与使用ComputeM和AlignNetworks的最优节点得分参数。它的网络规模,节点相似矩阵R,初始对准带够,节点分级,lookupNode查找表,作为参数。


值----------Value----------

The return value is list containing the node score vectors s0 and s1.
返回值是列表,其中包含的节点得分向量S0和S1。


作者(S)----------Author(s)----------


Joern P. Meier, Michal Kolar, Ville Mustonen, Michael Laessig, and Johannes Berg



举例----------Examples----------


  ex<-GenerateExample(dimA=22, dimB=22, filling=.5, covariance=.6,
    symmetric=TRUE, numOrths=10, correlated=seq(1,18))
  
  pinitial<-InitialAlignment(psize=34, r=ex$r, mode="reciprocal")
  
  lookupNode<-c(-.5,.5,1.5)
  nodeParams<-ComputeNodeParameters(dimA=22, dimB=22, ex$r,
    pinitial, lookupNode)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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