R语言 GOSemSim包 GOSet-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

GOSet-class(GOSemSim)
GOSet-class()所属R语言包：GOSemSim

                                        Class "GOSet"
                                         类“GOSet”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A GOSet contains two sets of GO identifiers.
一个GOSet包含两套GO的标识符。


插槽----------Slots----------




GOSet1: containing a vector of GO identifiers.
GOSet1：它包含了一个好标识的向量。




GOSet2: containing a vector of GO identifiers.
GOSet2：它包含了一个好标识的向量。


方法----------Methods----------

GO semantic similarity measure :
开始语义相似性度量：




sim signature(object = "GOSet", params="Params")
SIMsignature(object = "GOSet", params="Params")


作者（S）----------Author(s)----------


Guangchuang Yu <guangchuangyu@gmail.com>



参见----------See Also----------

GeneSet Params
GeneSetParams


举例----------Examples----------


## Setting Parameters...[＃设置参数...]
params <- new("Params", ontology="MF", organism="human", method="Wang")
## Setting GOSet...[＃设置GOSet ...]
go1 <- c("GO:0004022", "GO:0004024", "GO:0004023")
go2 <- c("GO:0009055", "GO:0020037")
gos <- new("GOSet", GOSet1=go1, GOSet2=go2)
## Calculating GO Semantic Similarities...[＃计算语义相似度...]
sim(gos, params)
## Setting Combine Method[＃设置Combine方法]
setCombineMethod(params) <- "rcmax.avg"
## Combining semantic similarity scores of multiple GO terms to one score.[＃相结合的一分多GO术语的语义相似度。]
sim(gos, params)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。