R语言 GOSemSim包 GeneSet-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

GeneSet-class(GOSemSim)
GeneSet-class()所属R语言包：GOSemSim

                                        Class "GeneSet"
                                         类“GeneSet”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A GeneSet contains two sets of Gene identifiers.
一个GeneSet包含两套基因标识。


插槽----------Slots----------




GeneSet1: containing a vector of Gene identifiers.
GeneSet1：含有基因标识的向量。




GeneSet2: containing a vector of Gene identifiers.
GeneSet2：含有基因标识的向量。


方法----------Methods----------

GO semantic similarity measure :
开始语义相似性度量：




sim signature(object = "GeneSet", params="Params", value = "numeric")
SIMsignature(object = "GeneSet", params="Params", value = "numeric")


作者（S）----------Author(s)----------


Guangchuang Yu <guangchuangyu@gmail.com>



参见----------See Also----------

GeneClusterSet Params
GeneClusterSetParams


举例----------Examples----------


        ## Setting Parameters...[＃设置参数...]
        params <- new("Params", ontology="MF", organism="human", method="Wang", combine="rcmax.avg")
        ## Setting GeneSet...[＃设置GeneSet ...]
        gs1 <- c("835", "5261","241", "994", "514", "533")
        gs2 <- c("578","582", "400", "409", "411")
        gs <- new("GeneSet", GeneSet1=gs1, GeneSet2=gs2)
        ## Calculating Gene Semantic Similarities...[＃计算语义相似度的基因...]
        #sim(gs, params)[SIM（GS，的params）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。