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R语言 GOSemSim包 GeneClusterSet-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 20:51:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
GeneClusterSet-class(GOSemSim)
GeneClusterSet-class()所属R语言包:GOSemSim

                                        Class "GeneClusterSet"
                                         类“GeneClusterSet”

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A GeneClusterSet contains a list of Gene clusters.
一个GeneClusterSet包含的基因簇。


插槽----------Slots----------




GeneClusters: containing a list of Gene clusters.
GeneClusters:含有基因簇的列表。


方法----------Methods----------

Gene Clusters semantic similarity measure :
基因簇的语义相似性度量:




sim signature(object = "GeneClusterSet", params="Params", value = "numeric")
SIMsignature(object = "GeneClusterSet", params="Params", value = "numeric")


作者(S)----------Author(s)----------


Guangchuang Yu <guangchuangyu@gmail.com>



参见----------See Also----------

GeneSet Params
GeneSetParams


举例----------Examples----------


        ## Setting Parameters...[#设置参数...]
        params <- new("Params", ontology="MF", organism="human", method="Wang", combine="rcmax")
        ## Setting GeneClusterSet...[#设置GeneClusterSet ...]
        cluster1 <- c("835", "5261","241", "994", "514", "517", "533")
        cluster2 <- c("578","582", "583", "400", "409", "411")
        cluster3 <- c("307", "308", "317", "321", "506", "540", "378", "388", "396")
        clusters <- list(a=cluster1, b=cluster2, c=cluster3)
        geneClusters <- new("GeneClusterSet", GeneClusters=clusters)
        ## Calculating Gene Clusters Semantic Similarities...[#计算基因簇的语义异同...]
        # sim(geneClusters, params)[SIM(geneClusters,的params)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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