R语言 goProfiles包 plotProfiles()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotProfiles(goProfiles)
plotProfiles()所属R语言包：goProfiles

                                        Plot functional profiles
                                         绘制功能概况

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots basic functional profiles created with the 'basicProfile' instruction. If several profiles have to be plot together they must be first merged using the 'mergeProfiles' function. The labels of the Y-axis of the plots are the descriptions of the GO Terms. If the label is longer than 20 characters
图的基本功能配置文件创建“basicProfile指令。如果多个配置文件是一起图，他们必须先合并使用“mergeProfiles”的功能。 Y轴的图上的标签是GO术语的描述。如果标签是超过20个字符


用法----------Usage----------


plotProfiles(aProf, aTitle = "Functional Profile", anOnto = NULL, percentage = FALSE,
HORIZVERT = TRUE, legendText = NULL, colores = c("white", "red"), multiplePlots = F, multipleWindows = T, labelWidth=25,...)



参数----------Arguments----------

参数：aProf
Functional profile to plot
绘制功能简介


参数：aTitle
Title for the figures
标题为“数字


参数：anOnto
Ontology (to appear in the title)
本体（出现在标题）


参数：percentage
Plot absolute or relative frequencies (not summing to 100)
图绝对或相对频率（不总结100）


参数：HORIZVERT
Plot horizontal or vertical bars
图水平或垂直线


参数：legendText
Text of the legend for the plot
图的传说文本


参数：colores
Colors to be used
要使用的颜色


参数：multiplePlots
Plot all profiles for a given dataset in one figure
画出一个数字在给定的数据集的所有配置文件


参数：multipleWindows
Open a new window after each plot
每个小区后打开一个新窗口


参数：labelWidth
Width of Y axis labels (Names of GO categories) in the plot
图Y轴标签的宽度（GO类别的名称）


参数：...
Other graphical parameters that should be passed for plotting
其他应通过绘图的图形参数


值----------Value----------

The plot
图


作者（S）----------Author(s)----------


Alex Sanchez



举例----------Examples----------


require(goProfiles)
data(prostateIds)
welsh.MF <- basicProfile (welsh01EntrezIDs[1:100], onto="MF", level=2, orgPackage="org.Hs.eg.db")
singh.MF <- basicProfile (singh01EntrezIDs[1:100], onto="MF", level=2, orgPackage="org.Hs.eg.db")
plotProfiles(welsh.MF,'Functional profiles for Welsh dataset',percentage=TRUE)
welsh.singh.MF <-mergeProfilesLists(welsh.MF, singh.MF, profNames=c("Welsh", "Singh"))
plotProfiles(welsh.singh.MF , percentage=TRUE, multiplePlots=TRUE, labelWidth=30)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。