gt.multtest(globaltest)
gt.multtest()所属R语言包:globaltest
Correct globaltest results for multiple testing (Deprecated)
多个测试(已过时)的的正确globaltest结果
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
(DEPRECATED: please use use p.adjust instead). Corrects the raw p-values resulting from a call to globaltest for multiple testing, using either Benjamini and Hochberg's False Discovery Rate or Holm's procedure for controlling
(不推荐使用:请使用p.adjust代替)。纠正原始的P-值从多个测试呼叫globaltest,使用,要么Benjamini和Hochberg虚假发现率或霍尔姆的控制程序
用法----------Usage----------
gt.multtest(gt, proc = c("FDR", "FWER"))
参数----------Arguments----------
参数:gt
The output of a call to globaltest.
输出调用globaltest的。
参数:proc
The procedure to be used. Either "FDR" for Benjamini and Hochberg's (1995) False Discovery Rate-controlling procedure or "FWER" for Holm's (1979) Family-Wise Error Rate controlling procedure.
要使用的程序。无论是“FDR”Benjamini和Hochberg(1995)假发现率控制过程或的“FWER”霍尔姆(1979)家庭智者错误率控制程序。
Details
详情----------Details----------
This function is completely based on the mt.rawp2adjp function from the
此功能是完全基于mt.rawp2adjp从功能
值----------Value----------
An object of class gt.result.
对象类gt.result。
注意----------Note----------
gt.multtest has been deprecated. Please use p.adjust instead.
gt.multtest已被弃用。请使用p.adjust代替。
This function must be called prior to any selection of
此功能必须调用之前的任何选择
作者(S)----------Author(s)----------
Jelle Goeman: <a href="mailto:j.j.goeman@lumc.nl">j.j.goeman@lumc.nl</a>; Jan Oosting
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
globaltest, gtGO.
globaltest,gtGO。
举例----------Examples----------
# Breast cancer data (ExpressionSet) from the Netherlands Cancer[从荷兰癌症乳腺癌数据(ExpressionSet)]
# Institute with annotation:[研究所与注释:]
data(vandeVijver)
data(annotation.vandeVijver)
gt <- globaltest(vandeVijver, "StGallen", annotation.vandeVijver)
sort(gt.multtest(gt))
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