gt.barplot-class(globaltest)
gt.barplot-class()所属R语言包:globaltest
Class "gt.barplot" for results of the functions geneplot and sampleplot (Deprecated)
类“gt.barplot”结果功能geneplot和sampleplot(已过时)
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The class gt.barplot stores the output of a call to
类gt.barplot存储输出的调用
插槽----------Slots----------
res: Object of class "matrix". The plotted values, with a row for each gene or sample, and the following columns: influence: the height of the bar, Einf: expected influence under the null hypothesis, sd.inf: standard deviation of the influence under the null hypothesis,
res:类“矩阵”的对象。绘制的值,为每一个基因或样本行,以下几列:influence栏的高度,Einf:零假设下的预期的影响,sd.inf:标准偏差影响的零假设下,
drawlabels: Object of class "logical".
drawlabels类的“逻辑”的对象。
labelsize: Object of class "numeric". The size of the gene/sample labels.
labelsize:类“数字”的对象。基因/样本标签的大小。
legend: The meaning of the colours of the bars, to be used in the legend.
legend:条形颜色的含义,将传说中的使用。
colour: The numbers of the colours used in the plot.
colour:在图中使用的颜色数。
colourCode: The meaning of the colours used (shorter version of legend.
colourCode:所使用的颜色的含义(legend短的版本。
方法----------Methods----------
show (gt.barplot): Summarizes plot in numbers.
数字秀(gt.barplot):总结的图。
plot (gt.barplot): Redraws the plot. Possible extra arguments:
图(gt.barplot):重绘的图。可能额外的参数:
"[" (gt.barplot): Extracts a subset of the genes or samples.
“[”(gt.barplot):提取的基因或样本的一个子集。
result (gt.barplot): Extracts the results matrix as a data.frame.
作为一个data.frame结果(gt.barplot):提取的结果矩阵。
length (gt.barplot): The number of bars (genes or samples) in the object.
长度(gt.barplot):条形(基因或样本)中的对象。
scale (gt.barplot): Scales the bars to unit standard deviation.
规模(gt.barplot):秤的单位标准差的条形。
z.score (gt.barplot): Calculates the z.scores for each bar: (influence - expected inf) / sd(inf).
z.score(gt.barplot):计算每个条形z.scores:(影响 - 预期INF)/ SD(INF)。
sort (gt.barplot): Sorts the bars to a decreasing z.score.
各种排序(gt.barplot):条形下降z.score的。
names (gt.barplot): The names of the genes or samples.
名称(gt.barplot):基因或样本的名称。
names<- (gt.result): Changes the names of the genes or samples.
名< - (gt.result):改变基因或样本的名称。
注意----------Note----------
gt.barplot has been deprecated: please use use covariates or subjects instead.
gt.barplot已过时:请使用covariates或subjects代替。
作者(S)----------Author(s)----------
Jelle Goeman: <a href="mailto:j.j.goeman@lumc.nl">j.j.goeman@lumc.nl</a>; Jan Oosting
参见----------See Also----------
sampleplot,
sampleplot
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