R语言 GGtools包 permEx()函数中文帮助文档(中英文对照)

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permEx(GGtools)
permEx()所属R语言包：GGtools

                                         permute expression data against genotype data in an smlSet
                                         置位在smlSet对基因型数据表达数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

permute expression data against genotype data in an smlSet
置位在smlSet对基因型数据表达数据


用法----------Usage----------


permEx(sms)



参数----------Arguments----------

参数：sms
an instance of smlSet-class  
一个smlSet-class的实例


值----------Value----------

an instance of smlSet-class
一个smlSet-class的实例


作者（S）----------Author(s)----------



VJ Carey <stvjc@channing.harvard.edu>




举例----------Examples----------


if (!exists("hmceuB36.2021")) hmceuB36.2021 <- getSS("GGtools", c("20", "21"))
library(illuminaHumanv1.db)
cptag = get("CPNE1", revmap(illuminaHumanv1SYMBOL))
indc = which(featureNames(hmceuB36.2021) == cptag[1])
hm = hmceuB36.2021[c(indc,1:19),]  # reduce problem[减少的问题]
td = tempdir()
curd = getwd()
setwd(td)
time.lapply = unix.time(e1 <- eqtlTests( hm, ~male, targdir="pex" ))
e1
hmp = permEx(hm)
e1perm = eqtlTests(hmp, ~male, targdir="permfoo", runname="permrun")
topFeats(probeId(cptag), mgr=e1, ffind=1, anno="illuminaHumanv1.db", useSym=FALSE)
topFeats(probeId(cptag), mgr=e1perm, ffind=1, anno="illuminaHumanv1.db", useSym=FALSE)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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