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R语言 GGtools包 ex6()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 19:47:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
ex6(GGtools)
ex6()所属R语言包:GGtools

                                         example exon region data
                                         例如外显子区域中的数据

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

example exon region data
例如外显子区域中的数据


用法----------Usage----------


data(ex6)



格式----------Format----------

The format is: Formal class 'GRanges' [package "GenomicRanges"] with 7 slots ..@ seqnames       :Formal class 'Rle' [package "IRanges"] with 5 slots .. .. ..@ values : Factor w/ 49 levels "chr1","chr1_random",..: 36 .. .. ..@ lengths        : int 12974 .. .. ..@ elementMetadata: NULL .. .. ..@ elementType    : chr "ANY" .. .. ..@ metadata       : list() ..@ ranges :Formal class 'IRanges' [package "IRanges"] with 6 slots .. .. ..@ start  : int [1:12974] 237101 249628 256880 280114 290854 293103 293769 293769 295822 336752 ... .. .. ..@ width  : int [1:12974] 460 34 83 50 75 172 73 2585 534 58 ... .. .. ..@ NAMES  : NULL .. .. ..@ elementMetadata: NULL .. .. ..@ elementType    : chr "integer" .. .. ..@ metadata       : list() ..@ strand :Formal class 'Rle' [package "IRanges"] with 5 slots .. .. ..@ values : Factor w/ 3 levels "+","-","*": 1 2 .. .. ..@ lengths        : int [1:2] 6235 6739 .. .. ..@ elementMetadata: NULL .. .. ..@ elementType    : chr "ANY" .. .. ..@ metadata       : list() ..@ seqlengths     : Named int [1:49] 247249719 1663265 135374737 113275 134452384 215294 132349534 114142980 186858 106368585 ... .. ..- attr(*, "names")= chr [1:49] "chr1" "chr1_random" "chr10" "chr10_random" ... ..@ elementMetadata:Formal class 'DataFrame' [package "IRanges"] with 6 slots .. .. ..@ rownames       : NULL .. .. ..@ nrows  : int 12974 .. .. ..@ elementMetadata: NULL .. .. ..@ elementType    : chr "ANY" .. .. ..@ metadata       : list() .. .. ..@ listData       ist of 1 .. .. .. ..$ exon_id: int [1:12974] 81518 81519 81520 81521 81522 81523 81524 81526 81525 81527 ... ..@ elementType    : chr "ANY" ..@ metadata       : list()
格式是:正式类的农庄“[包的”GenomicRanges“] 7个插槽.. @ seqnames的正式类的RLE”[包] 5个插槽的“IRanges”...... .. .. @值:因素W / 49的水平“chr1”,“chr1_random”,..:36 .. .. .. @长度:INT 12974 .. .. .. @ elementMetadata:空...... .. .. @ elementType:“任何”CHR .. .. .. @元数据:列表(范围).. @[包的“IRanges”类的正式IRanges] 6个插槽.. .. .. @开始:[1:12974] 237101 249628 256880 280114 290854 293103 293769 293769 295822 336752 ... .. .. .. @的宽度:int [1:12974] 460 34 83 50 75 172 73 2585 534 58 ... .. .. .. @名称:空.. .. .. @ elementMetadata:空...... .. .. @ elementType:CHR“整数”...... .. .. @元数据列表().. @股:正式类的RLE“包”IRanges“5个插槽...... .. @值..:因素W / 3级“+”,“ - ”,“*”:1 2 ...... .. .. @长度:INT [1:2] 6235 6739 .. .. .. @ elementMetadata:空...... .. .. @ elementType:“任何”CHR .. .. .. @元数据:列表().. @ seqlengths的名为INT [一时49] 247249719 1663265 135374737 113275 134452384 215294 132349534 114142980 186858 106368585 ... .. ..  -  ATTR(*,“名”)= CHR [1:49]“chr1”chr1_random“chr10”“chr10_random”... .. @ elementMetadata:正式类的DataFrame [包的“IRanges”] 6个插槽...... .. .. @ rownames的:空.. .. .. @ NROWS的:INT 12974 .. .. .. @ elementMetadata:空...... .. .. @ elementType:“任何”CHR .. .. .. @元数据列表().. .. .. @的listData:1 ...... .. .. .. $ exon_id:INT [1:12974] 81518 81519 81520 81521 81522 81523 81524 81526 81525 81527 ... .. @ elementType:“任何”CHR .. @元数据列表()


举例----------Examples----------


data(ex6)
ex6[1:4]
## maybe str(ex6) ; plot(ex6) ...[#也许STR(EX6);图(EX6)...]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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