ex6(GGtools)
ex6()所属R语言包:GGtools
example exon region data
例如外显子区域中的数据
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
example exon region data
例如外显子区域中的数据
用法----------Usage----------
data(ex6)
格式----------Format----------
The format is: Formal class 'GRanges' [package "GenomicRanges"] with 7 slots ..@ seqnames :Formal class 'Rle' [package "IRanges"] with 5 slots .. .. ..@ values : Factor w/ 49 levels "chr1","chr1_random",..: 36 .. .. ..@ lengths : int 12974 .. .. ..@ elementMetadata: NULL .. .. ..@ elementType : chr "ANY" .. .. ..@ metadata : list() ..@ ranges :Formal class 'IRanges' [package "IRanges"] with 6 slots .. .. ..@ start : int [1:12974] 237101 249628 256880 280114 290854 293103 293769 293769 295822 336752 ... .. .. ..@ width : int [1:12974] 460 34 83 50 75 172 73 2585 534 58 ... .. .. ..@ NAMES : NULL .. .. ..@ elementMetadata: NULL .. .. ..@ elementType : chr "integer" .. .. ..@ metadata : list() ..@ strand :Formal class 'Rle' [package "IRanges"] with 5 slots .. .. ..@ values : Factor w/ 3 levels "+","-","*": 1 2 .. .. ..@ lengths : int [1:2] 6235 6739 .. .. ..@ elementMetadata: NULL .. .. ..@ elementType : chr "ANY" .. .. ..@ metadata : list() ..@ seqlengths : Named int [1:49] 247249719 1663265 135374737 113275 134452384 215294 132349534 114142980 186858 106368585 ... .. ..- attr(*, "names")= chr [1:49] "chr1" "chr1_random" "chr10" "chr10_random" ... ..@ elementMetadata:Formal class 'DataFrame' [package "IRanges"] with 6 slots .. .. ..@ rownames : NULL .. .. ..@ nrows : int 12974 .. .. ..@ elementMetadata: NULL .. .. ..@ elementType : chr "ANY" .. .. ..@ metadata : list() .. .. ..@ listData ist of 1 .. .. .. ..$ exon_id: int [1:12974] 81518 81519 81520 81521 81522 81523 81524 81526 81525 81527 ... ..@ elementType : chr "ANY" ..@ metadata : list()
格式是:正式类的农庄“[包的”GenomicRanges“] 7个插槽.. @ seqnames的正式类的RLE”[包] 5个插槽的“IRanges”...... .. .. @值:因素W / 49的水平“chr1”,“chr1_random”,..:36 .. .. .. @长度:INT 12974 .. .. .. @ elementMetadata:空...... .. .. @ elementType:“任何”CHR .. .. .. @元数据:列表(范围).. @[包的“IRanges”类的正式IRanges] 6个插槽.. .. .. @开始:[1:12974] 237101 249628 256880 280114 290854 293103 293769 293769 295822 336752 ... .. .. .. @的宽度:int [1:12974] 460 34 83 50 75 172 73 2585 534 58 ... .. .. .. @名称:空.. .. .. @ elementMetadata:空...... .. .. @ elementType:CHR“整数”...... .. .. @元数据列表().. @股:正式类的RLE“包”IRanges“5个插槽...... .. @值..:因素W / 3级“+”,“ - ”,“*”:1 2 ...... .. .. @长度:INT [1:2] 6235 6739 .. .. .. @ elementMetadata:空...... .. .. @ elementType:“任何”CHR .. .. .. @元数据:列表().. @ seqlengths的名为INT [一时49] 247249719 1663265 135374737 113275 134452384 215294 132349534 114142980 186858 106368585 ... .. .. - ATTR(*,“名”)= CHR [1:49]“chr1”chr1_random“chr10”“chr10_random”... .. @ elementMetadata:正式类的DataFrame [包的“IRanges”] 6个插槽...... .. .. @ rownames的:空.. .. .. @ NROWS的:INT 12974 .. .. .. @ elementMetadata:空...... .. .. @ elementType:“任何”CHR .. .. .. @元数据列表().. .. .. @的listData:1 ...... .. .. .. $ exon_id:INT [1:12974] 81518 81519 81520 81521 81522 81523 81524 81526 81525 81527 ... .. @ elementType:“任何”CHR .. @元数据列表()
举例----------Examples----------
data(ex6)
ex6[1:4]
## maybe str(ex6) ; plot(ex6) ...[#也许STR(EX6);图(EX6)...]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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