R语言 ggbio包 plotOverview()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotOverview(ggbio)
plotOverview()所属R语言包：ggbio

                                        Plot stacked overview for genome
                                         图堆放基因组概览

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot stacked overview for genome with or without cytoband.
积叠或没有cytoband，基因组的概述。


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：obj
A GenomicRanges object, which include extra information about cytoband.
一个GenomicRanges对象，其中包括有关cytoband的额外信息。


参数：cytoband
Logical value. Default is FALSE. If TRUE, plotting cytoband.
逻辑值。默认为false。如果为TRUE，的图cytoband。


Details

详情----------Details----------

This function requires two column of the gieStain and name. Which you could get from getIdeogram function
此功能需要列gieStain和name。你可以得到getIdeogram功能


值----------Value----------

A ggplot object.
一个ggplot对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Tengfei Yin



举例----------Examples----------


library(GenomicRanges)
data(hg19IdeogramCyto)
## make shorter and clean labels[＃短和清洁的标签]
old.chrs <- seqnames(seqinfo(hg19IdeogramCyto))
new.chrs <- gsub("chr", "", old.chrs)
names(new.chrs) <- old.chrs
new.ideo <- renameSeqlevels(hg19IdeogramCyto, new.chrs)
## with cytoband[＃与cytoband]
p <- plotOverview(new.ideo, cytoband = TRUE)
print(p)
## with nocytoband[＃与nocytoband]
p <- plotOverview(new.ideo, cytoband = FALSE)
print(p)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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