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R语言 GGBase包 gwSnpScreenResult-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 19:42:58 | 显示全部楼层 |阅读模式
gwSnpScreenResult-class(GGBase)
gwSnpScreenResult-class()所属R语言包:GGBase

                                        Class "gwSnpScreenResult" – containers for GGtools gwSnpScreen
                                         类“gwSnpScreenResult” - 为GGtools gwSnpScreen的容器

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Class "gwSnpScreenResult" – container for GGtools gwSnpScreen
类“gwSnpScreenResult” - 为GGtools gwSnpScreen容器


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("gwSnpScreenResult", ...). These will be primarily lists of inference tables (snps are rows, columns are statistics and p-values).  Additional slots manage analysis metadata.
创建对象可以通过检测的形式new("gwSnpScreenResult", ...)。这些都将是主要推理表名单(SNPs是行,列统计和p值)。附加插槽管理元数据分析。

gwSnpScreenResult is intended for genome-wide analysis of expression for a single gene.
gwSnpScreenResult用于全基因组的一个单一的基因表达分析。

cwSnpScreenResult is intended for the restriction to a single chromosome.
cwSnpScreenResult旨在限制到一个单一的染色体。

multiGwSnpScreenResult is intended for analyses with multiple genes.
multiGwSnpScreenResult用于多个基因分析。

Because the vast majority of tests are uninformative, early filtering is important for managing object sizes. Instances of filteredGwSnpScreenResult and filteredMultiGwSnpScreenResult are created when a snpdepth parameter is used with gwSnpTests.
因为绝大多数的测试是无意义的,早期筛选重要的是为管理对象的大小。的filteredGwSnpScreenResult和filteredMultiGwSnpScreenResult的实例被创建时snpdepth参数与gwSnpTests使用。


插槽----------Slots----------




.Data: Object of class "list" containing inference tables (snps are rows, columns are statistics and
.Data:对象类"list"包含推理表(SNPS行,列统计和




gene: Object of class "character" typically
gene类"character"通常对象




psid: Object of class "character" the
psid类"character":对象




annotation: Object of class "character" vector
annotation:对象类"character"向量




formula: Object of class "formula" the formula used to fit the model relating expression to
formula:对象类"formula"使用有关的表达,以适应模型的公式


延伸----------Extends----------

Class "list", from data part. Class "vector", by class "list", distance 2. Class AssayData, by class "list",  distance 2.
类"list",从数据的一部分。类"vector",由类“列表”,距离为2。类AssayData,由类“列表”,距离为2。


方法----------Methods----------

plot and show
图和放映


作者(S)----------Author(s)----------


VJ Carey <stvjc@channing.harvard.edu>



举例----------Examples----------


showClass("gwSnpScreenResult")
showClass("cwSnpScreenResult")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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