R语言 Genominator包 collapseExpData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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collapseExpData(Genominator)
collapseExpData()所属R语言包：Genominator

                                         Combine multiple data sets
                                         结合多个数据集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a dataset with data from multiple experiments, and combines the data across multiple experiments according to a user-specified function.
此功能需要从多个实验数据集，并结合多个实验数据，根据用户指定的功能。


用法----------Usage----------


collapseExpData(expData, tablename = NULL,
  what = getColnames(expData, all = FALSE), groups = "COL",
  collapse = c("sum", "avg", "weighted.avg"), overwrite = FALSE,
  deleteOriginal = FALSE, verbose = getOption("verbose"))



参数----------Arguments----------

参数：expData
An object of class ExpData.  
对象类ExpData。


参数：tablename
Name of database table to write output data to.  
输出数据写入数据库表名。


参数：what
Data columns to apply collapse function to.  
数据列申请collapse功能。


参数：groups
Vector of length what indicating how columns should be grouped when applying collapse function.   
向量的长度what说明如何申请collapse功能时，应分组列。


参数：collapse
Function to apply to grouped columns.  
功能适用于分组的列。


参数：overwrite
Logical indicating whether database referred to in tablename argument should be overwritten.  
逻辑表明是否数据库中提到tablename参数应该覆盖。


参数：deleteOriginal
Logical indicating whether original database in ExpData object should be deleted.  
逻辑表示ExpData对象的原始数据库是否应该被删除。


参数：verbose
Logical indicating whether details should be printed.  
逻辑说明是否应印有细节。


Details

详情----------Details----------

This function can be thought of as similar to tapply, operating over the entries in the data set, applying the function specified in the collapse argument, grouping the data as indicated in the groups argument.
此功能可以被认为是类似tapply，经营数据集的条目，应用在collapse参数指定的函数，分组数据，如groups参数表明。


值----------Value----------

Returns an object of class ExpData.
类ExpData返回一个对象。


作者（S）----------Author(s)----------


James Bullard <a href="mailto:bullard@berkeley.edu">bullard@berkeley.edu</a>, Kasper Daniel
Hansen <a href="mailto:khansen@jhsph.edu">khansen@jhsph.edu</a>



参见----------See Also----------

See Genominator vignette for more information.  
看到Genominator更多信息插曲。


举例----------Examples----------


ed <- ExpData(system.file(package = "Genominator", "sample.db"),
              tablename = "raw")
nd <- importToExpData(head(ed, -1), dbFilename = tempfile(),
                      tablename = "collapsed")
head(nd)
cd <- collapseExpData(nd, tablename = "bio", overwrite = TRUE,
                      groups = c("mut", "mut", "wt", "wt"))
                     
head(cd)

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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