aggregateExpData(Genominator)
aggregateExpData()所属R语言包:Genominator
Collapse data into unique entries
到唯一条目的崩溃数据
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Collapses data based on unique combinations of values in a set of columns, by default adding a column giving counts of data entries with a particular combination.
基于独特的组合在一组列值默认情况下,添加一列数据项罪名给予特定组合,倍数数据。
用法----------Usage----------
aggregateExpData(expData, by = getIndexColumns(expData),
tablename = NULL, deleteOriginal = FALSE, overwrite = FALSE,
verbose = getOption("verbose"), colname = "counts",
aggregator = paste("count(", by[1], ")", sep = ""))
参数----------Arguments----------
参数:expData
An object of class ExpData.
对象类ExpData。
参数:by
Vector containing column names used to define unique entries.
向量用于定义唯一条目的列名。
参数:tablename
Name of database table to write output data to.
输出数据写入数据库表名。
参数:deleteOriginal
Logical indicating whether original database table in ExpData object should be deleted.
逻辑指示是否原始数据库表ExpData对象应该被删除。
参数:overwrite
Logical indicating whether database table referred to in tablename argument should be overwritten.
逻辑说明中提到tablename参数应该是覆盖到数据库中的表是否。
参数:verbose
Logical indicating whether details should be printed.
逻辑说明是否应印有细节。
参数:colname
Name of column for recording aggregation output (by default, counts).
录音聚集输出列的名称(默认情况下,counts)。
参数:aggregator
SQLite code used for aggregating. See Details for more information.
SQLite的代码中使用聚合。看到Details更多信息。
Details
详情----------Details----------
By default this function counts instances of data entries with a particular combination of the values in the set of columns indicated in the by argument. Other SQLite commands can be indicated using the aggregator argument.
默认情况下,这个函数计算的值在by参数表示的列集的特定组合数据项的实例。其他SQLite的命令可以使用aggregator参数表示。
值----------Value----------
Returns an ExpData object.
返回ExpData对象。
作者(S)----------Author(s)----------
James Bullard <a href="mailto:bullard@berkeley.edu">bullard@berkeley.edu</a>, Kasper Daniel
Hansen <a href="mailto:khansen@jhsph.edu">khansen@jhsph.edu</a>
参见----------See Also----------
See Genominator vignette for more information.
看到Genominator更多信息插曲。
举例----------Examples----------
N <- 10000 # the number of observations. [的若干意见。]
df <- data.frame(chr = sample(1:16, size = N, replace = TRUE),
location = sample(1:1000, size = N, replace = TRUE),
strand = sample(c(1L,-1L), size = N, replace = TRUE))
eDataRaw <- aggregateExpData(importToExpData(df, dbFilename = tempfile(),
tablename = "ex_tbl", overwrite = TRUE))
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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