plotby(genomes)
plotby()所属R语言包：genomes
Plot groups of genomes by release date
绘制基因组团体发行日期
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots the cumulative number of genomes by released date
绘制基因组的发布日期的累计数
用法----------Usage----------
plotby(x, groupby = "status", subset = NA, top = 5,
labels = FALSE, curdate=TRUE, abbrev = TRUE, flip = NA,
legend = "topleft", lbty = "o", lcol = 1, ltitle = NULL, lcex = 1,
lsort = TRUE, cex = 1, inset=0, ylim = NA, las = 1, lwd = 1, log = "",
xlab = "Release Date", ylab = "Genomes", type='l',
col = c("blue", "red", "green3", "magenta", "yellow"),
lty = 1:top, pch = c(15:18, 1:3), ...)
参数----------Arguments----------
参数：x
a genomes data frame
1的基因组数据框
参数：groupby
a column name in the genomes table or a vector to group by
在基因组的表或向量组列名
参数：subset
logical vector indicating rows to keep
逻辑向量，表示保留的行
参数：top
number of top groups to display
顶级组的数量，以显示
参数：labels
plot a single line with labeled points using genome name column
使用基因组name列绘制一个标记点的单行
参数： curdate
include the current date on x-axis, if false, then default is range of release dates
包括x轴的当前日期，如果为false，则默认为发行日期的范围
参数：abbrev
abbreviated genome names
略基因组名称
参数：flip
a number indicating where to flip labels from right to left, default is middle of plot
数字显示从右到左翻转标签，默认是中间的图
参数：legend
a legend keyword or vector of x,y coordinates, defaults to top-left corner. Use NA for no legend
一个传奇的关键字或向量的X，Y坐标，默认为左上角。使用没有传说中的NA
参数：lbty
legend box type
图例“框中，键入
参数：lcol
number of columns in legend
传说中的列数
参数：ltitle
legend title
图例标题
参数：lcex
legend size expansion
传说规模扩张
参数：inset
inset legend distances(s)
插图传说距离（S）
参数：lsort
sort legend by decreasing order of genomes, default true
传说为了降低基因组排序，默认为true
参数：cex
label size expansion
标签规模的扩大
参数：ylim
y axis limits
y轴限制
参数：las
rotate axis labels
旋转轴标签
参数：lwd
line width
线宽
参数：log
log scale
登录规模
参数：xlab
x axis label
X轴标签
参数：ylab
y axis label
Y轴标签
参数：type
plot type
图类型
参数：col
line or point colors
线或点颜色
参数：lty
line type
线路类型
参数：pch
point type
点类型
参数：...
additional items passed to plot
其他项目传递到图
Details
详情----------Details----------
Two different plot types are available. The default is to plot multiple lines, one for each group (like matplot). If labels=TRUE, then a single line is drawn with different labeled points for each
两个不同类型的图。默认是绘制多行，每组一（如matplot）。 labels=TRUE如果，然后单行绘制为每个不同的标记点
值----------Value----------
A plot of released dates by group
一组发布日期图
作者（S）----------Author(s)----------
Chris Stubben
参见----------See Also----------
plot.genomes
plot.genomes
举例----------Examples----------
data(lproks)
# default group is status[默认组是状态]
plotby(lproks)
plotby(lproks, 'habitat', top=3)
## groupby can be a vector[＃groupby函数可以是一个向量]
plotby(lproks, genus(lproks$name), log='y', lcex=.7)
plotby(lproks, factor(lproks$pathogen %in% c("No"),
labels=c("Pathogen", "Non-pathogen")), pathogen!="")
# OR plot labels[或图标签]
plotby(lproks, subset=name %like% 'Yersinia pestis*', labels=TRUE, cex=.7, lbty='n')
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 19:25:15
